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利用转录激活样效应因子实现5-甲基胞嘧啶检测的单核苷酸分辨率。

Achieving single-nucleotide resolution of 5-methylcytosine detection with TALEs.

作者信息

Kubik Grzegorz, Summerer Daniel

机构信息

Department of Chemistry, University of Konstanz, Universitätsstrasse 10, 78457 Konstanz (Germany).

出版信息

Chembiochem. 2015 Jan 19;16(2):228-31. doi: 10.1002/cbic.201402408. Epub 2014 Dec 17.

DOI:10.1002/cbic.201402408
PMID:25522353
Abstract

We report engineered transcription-activator-like effectors (TALEs) as the first DNA-binding molecules that detect 5-methylcytosine (mC) at single-nucleotide resolution with fully programmable sequence selectivity. This is achieved by a design strategy such that a single cytosine (C) in a DNA sequence is selectively interrogated for its mC-modification level by targeting with a discriminatory TALE repeat; other Cs are ignored by targeting with universal-binding TALE repeats.

摘要

我们报告了工程化转录激活样效应因子(TALEs),这是首批能够以完全可编程的序列选择性在单核苷酸分辨率下检测5-甲基胞嘧啶(mC)的DNA结合分子。这是通过一种设计策略实现的,即通过用具有鉴别性的TALE重复序列靶向,对DNA序列中的单个胞嘧啶(C)的mC修饰水平进行选择性询问;其他的C则通过用通用结合TALE重复序列靶向而被忽略。

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