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氟代辅助合成(E)-5-[3-氨基烯丙基]-尿苷-5'-O-三磷酸酯。

Fluorous-assisted synthesis of (E)-5-[3-aminoallyl]-uridine-5'-O-triphosphate.

作者信息

Kore Anilkumar R, Yang Bo, Srinivasan Balasubramanian

机构信息

Life Sciences Solutions Group, Thermo Fisher Scientific, Austin, Texas.

出版信息

Curr Protoc Nucleic Acid Chem. 2015 Mar 9;60:1.33.1-1.33.10. doi: 10.1002/0471142700.nc0133s60.

DOI:10.1002/0471142700.nc0133s60
PMID:25754887
Abstract

An efficient, reliable method for the chemical synthesis of (E)-5-[3-aminoallyl]-uridine-5'-O-triphosphate (AA-UTP), starting from 5-iodouridine, is described. This new strategy features the involvement of one-pot triphosphate formation and fluorous solid-phase extraction (F-SPE). The one-pot synthesis involves the mono phosphorylation of fluorous-tagged uridine, followed by the reaction with pyrophosphate to afford the fluorous-tagged AA-UTP. The F-SPE is achieved by installing a fluorous-tag onto the uridine prior to triphosphate formation, purification via F-SPE, and cleavage of the fluorous-tag. It is worth mentioning that this protocol produces AA-UTP in high yield and purity using one simple F-SPE; no conventional column chromatography is involved.

摘要

本文描述了一种从5-碘尿苷开始,高效、可靠地化学合成(E)-5-[3-氨基烯丙基]-尿苷-5'-O-三磷酸(AA-UTP)的方法。这种新策略的特点是一锅法形成三磷酸酯和氟固相萃取(F-SPE)。一锅法合成包括对氟标记的尿苷进行单磷酸化,然后与焦磷酸反应生成氟标记的AA-UTP。F-SPE是通过在形成三磷酸酯之前在尿苷上安装一个氟标记,通过F-SPE进行纯化,以及去除氟标记来实现的。值得一提的是,该方案使用一种简单的F-SPE就能以高产率和高纯度生产AA-UTP;无需传统的柱色谱法。

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