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NGL Viewer:一款用于分子可视化的网络应用程序。

NGL Viewer: a web application for molecular visualization.

作者信息

Rose Alexander S, Hildebrand Peter W

机构信息

Institut für Medizinische Physik und Biophysik, AG ProteInformatics, Charité-Universitätsmedizin Berlin, Charitéplatz 1, 10117 Berlin, Germany

Institut für Medizinische Physik und Biophysik, AG ProteInformatics, Charité-Universitätsmedizin Berlin, Charitéplatz 1, 10117 Berlin, Germany.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2015 Jul 1;43(W1):W576-9. doi: 10.1093/nar/gkv402. Epub 2015 Apr 29.

DOI:10.1093/nar/gkv402
PMID:25925569
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC4489237/
Abstract

The NGL Viewer (http://proteinformatics.charite.de/ngl) is a web application for the visualization of macromolecular structures. By fully adopting capabilities of modern web browsers, such as WebGL, for molecular graphics, the viewer can interactively display large molecular complexes and is also unaffected by the retirement of third-party plug-ins like Flash and Java Applets. Generally, the web application offers comprehensive molecular visualization through a graphical user interface so that life scientists can easily access and profit from available structural data. It supports common structural file-formats (e.g. PDB, mmCIF) and a variety of molecular representations (e.g. 'cartoon, spacefill, licorice'). Moreover, the viewer can be embedded in other web sites to provide specialized visualizations of entries in structural databases or results of structure-related calculations.

摘要

NGL查看器(http://proteinformatics.charite.de/ngl)是一款用于可视化大分子结构的网络应用程序。通过充分利用现代网络浏览器(如WebGL)在分子图形方面的功能,该查看器可以交互式地显示大型分子复合物,并且不受Flash和Java小程序等第三方插件停用的影响。一般来说,该网络应用程序通过图形用户界面提供全面的分子可视化,以便生命科学家能够轻松访问可用的结构数据并从中受益。它支持常见的结构文件格式(如PDB、mmCIF)和多种分子表示形式(如“卡通、空间填充、甘草糖”)。此外,该查看器可以嵌入到其他网站中,以提供结构数据库条目的专门可视化或与结构相关的计算结果。

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