• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

链霉菌属TP-A0882菌株的基因组序列草图揭示了假定的丁内酯生物合成途径。

Draft genome sequence of Streptomyces sp. TP-A0882 reveals putative butyrolactol biosynthetic pathway.

作者信息

Komaki Hisayuki, Ichikawa Natsuko, Hosoyama Akira, Fujita Nobuyuki, Igarashi Yasuhiro

机构信息

Biological Resource Center, National Institute of Technology and Evaluation (NBRC), Chiba 292-0818, Japan

NBRC, Tokyo 151-0066, Japan.

出版信息

FEMS Microbiol Lett. 2015 Oct;362(20). doi: 10.1093/femsle/fnv155. Epub 2015 Sep 3.

DOI:10.1093/femsle/fnv155
PMID:26337155
Abstract

We report the draft genome sequence of marine-derived Streptomyces sp. TP-A0882, a producer of buryrolactol, an antifungal γ-lactone-containing polyketide. The genome harbored at least three type I polyketide synthase (PKS), three type II PKS, four nonribosomal peptide synthetase (NRPS) and two hybrid PKS/NRPS gene clusters. Annotation of gene functions enabled us to identify the type I PKS gene cluster for butyrolactol biosynthesis and propose a plausible biosynthetic pathway for this unique polyketide.

摘要

我们报道了海洋来源的链霉菌属菌株TP-A0882的基因组序列草图,该菌株是含抗真菌γ-内酯的聚酮化合物丁内酯的生产者。该基因组包含至少三个I型聚酮合酶(PKS)、三个II型PKS、四个非核糖体肽合成酶(NRPS)和两个杂合PKS/NRPS基因簇。基因功能注释使我们能够鉴定出丁内酯生物合成的I型PKS基因簇,并为这种独特的聚酮化合物提出一个合理的生物合成途径。

相似文献

1
Draft genome sequence of Streptomyces sp. TP-A0882 reveals putative butyrolactol biosynthetic pathway.链霉菌属TP-A0882菌株的基因组序列草图揭示了假定的丁内酯生物合成途径。
FEMS Microbiol Lett. 2015 Oct;362(20). doi: 10.1093/femsle/fnv155. Epub 2015 Sep 3.
2
Biosynthesis of akaeolide and lorneic acids and annotation of type I polyketide synthase gene clusters in the genome of Streptomyces sp. NPS554.链霉菌NPS554基因组中akaeolide和洛尼酸的生物合成及I型聚酮合酶基因簇的注释
Mar Drugs. 2015 Jan 16;13(1):581-96. doi: 10.3390/md13010581.
3
Draft genome sequence of sp. TP-A0867, an alchivemycin producer.阿齐霉素产生菌sp. TP - A0867的基因组序列草图
Stand Genomic Sci. 2016 Oct 24;11:85. doi: 10.1186/s40793-016-0207-1. eCollection 2016.
4
Draft genome sequence of marine-derived Streptomyces sp. TP-A0598, a producer of anti-MRSA antibiotic lydicamycins.海洋来源的链霉菌属TP-A0598的基因组序列草图,抗耐甲氧西林金黄色葡萄球菌抗生素利迪霉素的产生菌
Stand Genomic Sci. 2015 Aug 26;10:58. doi: 10.1186/s40793-015-0046-5. eCollection 2015.
5
Draft genome sequence of sp. MWW064 for elucidating the rakicidin biosynthetic pathway.用于阐明拉基西丁生物合成途径的MWW064菌株基因组序列草图。
Stand Genomic Sci. 2016 Oct 21;11:83. doi: 10.1186/s40793-016-0205-3. eCollection 2016.
6
Characterization of biosynthetic gene cluster for the production of virginiamycin M, a streptogramin type A antibiotic, in Streptomyces virginiae.弗吉尼亚链霉菌中用于生产维吉尼亚霉素M(一种A型链阳性菌素抗生素)的生物合成基因簇的表征
Gene. 2007 May 15;393(1-2):31-42. doi: 10.1016/j.gene.2006.12.035. Epub 2007 Jan 20.
7
Comparative analysis of rapamycin biosynthesis clusters between Actinoplanes sp. N902-109 and Streptomyces hygroscopicus ATCC29253.游动放线菌属N902-109与吸水链霉菌ATCC29253中雷帕霉素生物合成基因簇的比较分析。
Chin J Nat Med. 2015 Feb;13(2):90-8. doi: 10.1016/S1875-5364(15)60012-7.
8
Biosynthesis of the Novel Macrolide Antibiotic Anthracimycin.新型大环内酯类抗生素炭疽霉素的生物合成
ACS Chem Biol. 2015 Nov 20;10(11):2468-79. doi: 10.1021/acschembio.5b00525. Epub 2015 Sep 8.
9
Diversity of nonribosomal peptide synthetase and polyketide synthase gene clusters among taxonomically close Streptomyces strains.分类上相近的链霉菌菌株中非核糖体肽合成酶和聚酮合酶基因簇的多样性。
Sci Rep. 2018 May 2;8(1):6888. doi: 10.1038/s41598-018-24921-y.
10
Nonlinear Biosynthetic Assembly of Alpiniamide by a Hybrid /-AT PKS-NRPS.杂合 /-AT PKS-NRPS 介导的 Alpiniamide 的非线性生物合成组装。
ACS Chem Biol. 2020 Apr 17;15(4):1067-1077. doi: 10.1021/acschembio.0c00081. Epub 2020 Apr 6.

引用本文的文献

1
Taxonomic Positions of a Nyuzenamide-Producer and Its Closely Related Strains.一种纽津酰胺产生菌及其近缘菌株的分类地位。
Microorganisms. 2022 Feb 2;10(2):349. doi: 10.3390/microorganisms10020349.
2
Diversity of nonribosomal peptide synthetase and polyketide synthase gene clusters among taxonomically close Streptomyces strains.分类上相近的链霉菌菌株中非核糖体肽合成酶和聚酮合酶基因簇的多样性。
Sci Rep. 2018 May 2;8(1):6888. doi: 10.1038/s41598-018-24921-y.
3
Biosynthetic origin of butyrolactol A, an antifungal polyketide produced by a marine-derived .
由海洋来源的抗真菌聚酮化合物丁内酯A的生物合成起源 。
Beilstein J Org Chem. 2017 Mar 8;13:441-450. doi: 10.3762/bjoc.13.47. eCollection 2017.
4
Antimicrobial potential and taxonomic investigation of piezotolerant Streptomyces sp. NIOT-Ch-40 isolated from deep-sea sediment.从深海沉积物中分离出的耐压链霉菌NIOT-Ch-40的抗菌潜力及分类学研究
World J Microbiol Biotechnol. 2017 Feb;33(2):27. doi: 10.1007/s11274-016-2193-2. Epub 2017 Jan 2.