• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

使用混合慢病毒CRISPR文库的实际考量

Practical Considerations for Using Pooled Lentiviral CRISPR Libraries.

作者信息

McDade Joel R, Waxmonsky Nicole C, Swanson Lianna E, Fan Melina

机构信息

Addgene, Cambridge, Massachusetts.

出版信息

Curr Protoc Mol Biol. 2016 Jul 1;115:31.5.1-31.5.13. doi: 10.1002/cpmb.8.

DOI:10.1002/cpmb.8
PMID:27366891
Abstract

CRISPR/Cas9 technology is ideally suited for genome-wide screening applications due to the ease of generating guide RNAs (gRNAs) and the versatility of Cas9 or Cas9 derivatives to knockout, repress, or activate expression of target genes. Several pooled lentiviral CRISPR libraries have been developed and are now publicly available, but while using CRISPR/Cas9 for genetic experiments has become widely adopted, genome-wide screening experiments remain technically challenging. This review covers the basics of CRISPR/Cas9, describes several publicly available CRISPR libraries, and provides a general protocol for conducting genome-wide screening experiments using CRISPR/Cas9. © 2016 by John Wiley & Sons, Inc.

摘要

由于易于生成向导RNA(gRNA)以及Cas9或Cas9衍生物在敲除、抑制或激活靶基因表达方面的多功能性,CRISPR/Cas9技术非常适合全基因组筛选应用。已经开发了几个汇集的慢病毒CRISPR文库,现在可以公开获得,但是尽管使用CRISPR/Cas9进行基因实验已被广泛采用,但全基因组筛选实验在技术上仍然具有挑战性。本综述涵盖了CRISPR/Cas9的基础知识,描述了几个公开可用的CRISPR文库,并提供了使用CRISPR/Cas9进行全基因组筛选实验的一般方案。© 2016约翰威立父子公司版权所有。

相似文献

1
Practical Considerations for Using Pooled Lentiviral CRISPR Libraries.使用混合慢病毒CRISPR文库的实际考量
Curr Protoc Mol Biol. 2016 Jul 1;115:31.5.1-31.5.13. doi: 10.1002/cpmb.8.
2
Genome-wide recessive genetic screening in mammalian cells with a lentiviral CRISPR-guide RNA library.利用慢病毒 CRISPR-guide RNA 文库对哺乳动物细胞进行全基因组隐性遗传筛选。
Nat Biotechnol. 2014 Mar;32(3):267-73. doi: 10.1038/nbt.2800. Epub 2013 Dec 23.
3
SeqCor: correct the effect of guide RNA sequences in clustered regularly interspaced short palindromic repeats/Cas9 screening by machine learning algorithm.SeqCor:通过机器学习算法纠正簇状规则间隔短回文重复序列/Cas9 筛选中引导 RNA 序列的影响。
J Genet Genomics. 2020 Nov 20;47(11):672-680. doi: 10.1016/j.jgg.2020.10.007. Epub 2020 Nov 28.
4
Adapting CRISPR/Cas9 for functional genomics screens.将CRISPR/Cas9应用于功能基因组学筛选。
Methods Enzymol. 2014;546:193-213. doi: 10.1016/B978-0-12-801185-0.00010-6.
5
CRISPR-Cas9-Guided Genome Engineering in Caenorhabditis elegans.秀丽隐杆线虫中CRISPR-Cas9引导的基因组工程
Curr Protoc Mol Biol. 2019 Dec;129(1):e106. doi: 10.1002/cpmb.106.
6
Genome-scale CRISPR pooled screens.全基因组规模的CRISPR混合筛选
Anal Biochem. 2017 Sep 1;532:95-99. doi: 10.1016/j.ab.2016.05.014. Epub 2016 Jun 1.
7
Protocols for CRISPR-Cas9 Screening in Lymphoma Cell Lines.淋巴瘤细胞系中CRISPR-Cas9筛选方案
Methods Mol Biol. 2019;1956:337-350. doi: 10.1007/978-1-4939-9151-8_16.
8
Doxycycline-Dependent Self-Inactivation of CRISPR-Cas9 to Temporally Regulate On- and Off-Target Editing.依赖于强力霉素的 CRISPR-Cas9 自我失活以时间调节靶标和非靶标编辑。
Mol Ther. 2020 Jan 8;28(1):29-41. doi: 10.1016/j.ymthe.2019.09.006. Epub 2019 Sep 12.
9
Gene Disruption Using CRISPR-Cas9 Technology.使用CRISPR-Cas9技术进行基因敲除
Methods Mol Biol. 2019;1881:201-209. doi: 10.1007/978-1-4939-8876-1_16.
10
Cas9-based genome editing in Drosophila.基于Cas9的果蝇基因组编辑。
Methods Enzymol. 2014;546:415-39. doi: 10.1016/B978-0-12-801185-0.00019-2.

引用本文的文献

1
Protocol to perform multiplexed assays of variant effect using curated loci prime editing.使用经过整理的位点进行碱基编辑来进行变异效应多重分析的方案。
STAR Protoc. 2025 Jun 20;6(2):103851. doi: 10.1016/j.xpro.2025.103851. Epub 2025 May 25.
2
High-fidelity CRISPR/Cas12a dual-crRNA screening reveals novel synergistic interactions in hepatocellular carcinoma.高保真 CRISPR/Cas12a 双 crRNA 筛选揭示肝癌中的新型协同相互作用。
Clin Transl Med. 2024 Jul;14(7):e1758. doi: 10.1002/ctm2.1758.
3
Genome-scale CRISPR-Cas9 screening in stem cells: theories, applications and challenges.
基于干细胞的全基因组 CRISPR-Cas9 筛选:理论、应用和挑战。
Stem Cell Res Ther. 2024 Jul 19;15(1):218. doi: 10.1186/s13287-024-03831-z.
4
Advancements in CRISPR screens for the development of cancer immunotherapy strategies.用于癌症免疫治疗策略开发的CRISPR筛选技术进展。
Mol Ther Oncolytics. 2023 Oct 5;31:100733. doi: 10.1016/j.omto.2023.100733. eCollection 2023 Dec 19.
5
High-Throughput CRISPR Screening in Hematological Neoplasms.血液肿瘤中的高通量CRISPR筛选
Cancers (Basel). 2022 Jul 25;14(15):3612. doi: 10.3390/cancers14153612.
6
Rescue of Recombinant Adenoviruses by CRISPR/Cas-Mediated Terminal Resolution.通过CRISPR/Cas介导的末端切割拯救重组腺病毒
Front Microbiol. 2022 Mar 18;13:854690. doi: 10.3389/fmicb.2022.854690. eCollection 2022.
7
Genes and compounds that increase type VII collagen expression as potential treatments for dystrophic epidermolysis bullosa.增加 VII 型胶原蛋白表达的基因和化合物作为潜在的治疗营养不良性大疱性表皮松解症的方法。
Exp Dermatol. 2022 Jul;31(7):1065-1075. doi: 10.1111/exd.14555. Epub 2022 Mar 9.
8
Applying CRISPR Screen in Diabetes Research.应用 CRISPR 筛选技术于糖尿病研究
Diabetes. 2021 Sep;70(9):1962-1969. doi: 10.2337/dbi20-0047. Epub 2021 Jun 23.
9
Functional Screening Techniques to Identify Long Non-Coding RNAs as Therapeutic Targets in Cancer.用于鉴定长链非编码RNA作为癌症治疗靶点的功能筛选技术
Cancers (Basel). 2020 Dec 9;12(12):3695. doi: 10.3390/cancers12123695.
10
Genome editing of immune cells using CRISPR/Cas9.使用CRISPR/Cas9对免疫细胞进行基因组编辑。
BMB Rep. 2021 Jan;54(1):59-69. doi: 10.5483/BMBRep.2021.54.1.245.