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在软组织血管纤维瘤中,由t(5;8;17)(p15;q13;q21)和t(4;5)(q24;q31)易位产生的基因融合AHRR-NCOA2、NCOA2-ETV4、ETV4-AHRR、P4HA2-TBCK和TBCK-P4HA2 。

Gene fusions AHRR-NCOA2, NCOA2-ETV4, ETV4-AHRR, P4HA2-TBCK, and TBCK-P4HA2 resulting from the translocations t(5;8;17)(p15;q13;q21) and t(4;5)(q24;q31) in a soft tissue angiofibroma.

作者信息

Panagopoulos Ioannis, Gorunova Ludmila, Viset Trond, Heim Sverre

机构信息

Section for Cancer Cytogenetics, Institute for Cancer Genetics and Informatics, The Norwegian Radium Hospital, Oslo University Hospital, Oslo, Norway.

Department of Pathology and Medical Genetics, St. Olavs Hospital, Trondheim University Hospital, Trondheim, Norway.

出版信息

Oncol Rep. 2016 Nov;36(5):2455-2462. doi: 10.3892/or.2016.5096. Epub 2016 Sep 15.

Abstract

We present an angiofibroma of soft tissue with the karyotype 46,XY,t(4;5)(q24;q31),t(5;8;17)(p15;q13;q21)[8]/46,XY,t(1;14)(p31;q32)[2]/46,XY[3]. RNA‑sequencing showed that the t(4;5)(q24;q31) resulted in recombination of the genes TBCK on 4q24 and P4HA2 on 5q31.1 with generation of an in‑frame TBCK‑P4HA2 and the reciprocal but out‑of‑frame P4HA2‑TBCK fusion transcripts. The putative TBCK‑P4HA2 protein would contain the kinase, the rhodanese‑like domain, and the Tre‑2/Bub2/Cdc16 (TBC) domains of TBCK together with the P4HA2 protein which is a component of the prolyl 4‑hydroxylase. The t(5;8;17)(p15;q13;q21) three‑way chromosomal translocation targeted AHRR (on 5p15), NCOA2 (on 8q13), and ETV4 (on 17q21) generating the in‑frame fusions AHRR‑NCOA2 and NCOA2‑ETV4 as well as an out‑of‑frame ETV4‑AHRR transcript. In the AHRR‑NCOA2 protein, the C‑terminal part of AHRR is replaced by the C‑terminal part of NCOA2 which contains two activation domains. The NCOA2‑ETV4 protein would contain the helix‑loop‑helix, PAS_9 and PAS_11, CITED domains, the SRC‑1 domain of NCOA2 and the ETS DNA‑binding domain of ETV4. No fusion gene corresponding to t(1;14)(p31;q32) was found. Our findings indicate that, in spite of the recurrence of AHRR‑NCOA2 in angiofibroma of soft tissue, additional genetic events (or fusion genes) might be required for the development of this tumor.

摘要

我们报告一例软组织血管纤维瘤,其核型为46,XY,t(4;5)(q24;q31),t(5;8;17)(p15;q13;q21)[8]/46,XY,t(1;14)(p31;q32)[2]/46,XY[3]。RNA测序显示,t(4;5)(q24;q31)导致4号染色体q24上的TBCK基因与5号染色体q31.1上的P4HA2基因发生重组,产生一个读码框内的TBCK - P4HA2融合转录本以及一个反向但读码框外的P4HA2 - TBCK融合转录本。推测的TBCK - P4HA2蛋白将包含TBCK的激酶结构域、类硫氰酸酶结构域和Tre - 2/Bub2/Cdc16(TBC)结构域,以及作为脯氨酰4 - 羟化酶组分的P4HA2蛋白。t(5;8;17)(p15;q13;q21)这种三向染色体易位靶向了AHRR(位于5号染色体p15)、NCOA2(位于8号染色体q13)和ETV4(位于17号染色体q21),产生了读码框内的融合基因AHRR - NCOA2和NCOA2 - ETV4,以及一个读码框外的ETV4 - AHRR转录本。在AHRR - NCOA2蛋白中,AHRR的C末端部分被包含两个激活结构域的NCOA2的C末端部分所取代。NCOA2 - ETV4蛋白将包含螺旋 - 环 - 螺旋结构域、PAS_9和PAS_11结构域、CITED结构域、NCOA2的SRC - 1结构域以及ETV4的ETS DNA结合结构域。未发现与t(1;14)(p31;q32)相对应的融合基因。我们的研究结果表明,尽管AHRR - NCOA2在软组织血管纤维瘤中反复出现,但该肿瘤的发生可能还需要其他遗传事件(或融合基因)。

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