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一株对杂草柱腺独行菜具有除草特性的内生绿黄假单胞菌的高质量基因组草图序列

High-Quality Draft Genome Sequence of an Endophytic Pseudomonas viridiflava Strain with Herbicidal Properties against Its Host, the Weed Lepidium draba L.

作者信息

Samad Abdul, Trognitz Friederike, Antonielli Livio, Compant Stéphane, Sessitsch Angela

机构信息

AIT Austrian Institute of Technology GmbH, Bioresources Unit, Tulln, Austria.

AIT Austrian Institute of Technology GmbH, Bioresources Unit, Tulln, Austria

出版信息

Genome Announc. 2016 Oct 20;4(5):e01170-16. doi: 10.1128/genomeA.01170-16.

Abstract

Here, we report the draft genome sequence of Pseudomonas viridiflava strain CDRTc14 a pectinolytic bacterium showing herbicidal activity, isolated from the root of Lepidium draba L. growing as a weed in an Austrian vineyard. The availability of this genome sequence allows us to investigate the genetic basis of plant-microbe interactions.

摘要

在此,我们报告了绿黄假单胞菌菌株CDRTc14的基因组序列草图,该菌株是一种具有除草活性的果胶分解细菌,从奥地利葡萄园里作为杂草生长的辣根独行菜的根部分离得到。该基因组序列的可得性使我们能够研究植物-微生物相互作用的遗传基础。

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