• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

蒙特卡罗方法在经合组织原则指导下的SIRT1抑制剂定量构效关系建模中的应用。

Use of the Monte Carlo Method for OECD Principles-Guided QSAR Modeling of SIRT1 Inhibitors.

作者信息

Kumar Ashwani, Chauhan Shilpi

机构信息

Department of Pharmaceutical Sciences, Guru Jambheshwar University of Science and Technology, Hisar, Haryana, India.

出版信息

Arch Pharm (Weinheim). 2017 Jan;350(1). doi: 10.1002/ardp.201600268. Epub 2016 Dec 26.

DOI:10.1002/ardp.201600268
PMID:28025857
Abstract

SIRT1 inhibitors offer therapeutic potential for the treatment of a number of diseases including cancer and human immunodeficiency virus infection. A diverse series of 45 compounds with reported SIRT1 inhibitory activity has been employed for the development of quantitative structure-activity relationship (QSAR) models using the Monte Carlo optimization method. This method makes use of simplified molecular input line entry system notation of the molecular structure. The QSAR models were built up according to OECD principles. Three subsets of three splits were examined and validated by respective external sets. All the three described models have good statistical quality. The best model has the following statistical characteristics: R  = 0.8350, Q  = 0.7491 for the test set and R  = 0.9655, Q  = 0.9261 for the validation set. In the mechanistic interpretation, structural attributes responsible for the endpoint increase and decrease are defined. Further, the design of some prospective SIRT1 inhibitors is also presented on the basis of these structural attributes.

摘要

SIRT1抑制剂为包括癌症和人类免疫缺陷病毒感染在内的多种疾病的治疗提供了潜在的治疗方法。已使用一系列45种具有报道的SIRT1抑制活性的化合物,采用蒙特卡罗优化方法开发定量构效关系(QSAR)模型。该方法利用分子结构的简化分子输入线性条目系统表示法。QSAR模型是根据经合组织原则建立的。对三个拆分的三个子集进行了检查,并通过各自的外部集进行了验证。所描述的所有三个模型都具有良好的统计质量。最佳模型具有以下统计特征:测试集的R = 0.8350,Q = 0.7491;验证集的R = 0.9655,Q = 0.9261。在机理解释中,定义了导致终点增加和减少的结构属性。此外,还基于这些结构属性提出了一些前瞻性SIRT1抑制剂的设计。

相似文献

1
Use of the Monte Carlo Method for OECD Principles-Guided QSAR Modeling of SIRT1 Inhibitors.蒙特卡罗方法在经合组织原则指导下的SIRT1抑制剂定量构效关系建模中的应用。
Arch Pharm (Weinheim). 2017 Jan;350(1). doi: 10.1002/ardp.201600268. Epub 2016 Dec 26.
2
QSAR Differential Model for Prediction of SIRT1 Modulation using Monte Carlo Method.使用蒙特卡罗方法预测SIRT1调节的定量构效关系差异模型。
Drug Res (Stuttg). 2017 Mar;67(3):156-162. doi: 10.1055/s-0042-119725. Epub 2016 Dec 19.
3
Monte Carlo method based QSAR modelling of natural lipase inhibitors using hybrid optimal descriptors.基于蒙特卡罗方法,使用混合最优描述符对天然脂肪酶抑制剂进行定量构效关系建模。
SAR QSAR Environ Res. 2017 Mar;28(3):179-197. doi: 10.1080/1062936X.2017.1293729. Epub 2017 Mar 8.
4
Use of Simplified Molecular Input Line Entry System and molecular graph based descriptors in prediction and design of pancreatic lipase inhibitors.应用简化分子线性输入系统和基于分子图的描述符进行胰腺脂肪酶抑制剂的预测和设计。
Future Med Chem. 2018 Jul;10(13):1603-1622. doi: 10.4155/fmc-2018-0024.
5
Interpretable SMILES-based QSAR Model of Inhibitory Activity of Sirtuins 1 and 2.基于可解释 SMILES 的 Sirtuins 1 和 2 抑制活性的定量构效关系模型。
Comb Chem High Throughput Screen. 2021;24(8):1217-1228. doi: 10.2174/1386207323666200902141907.
6
Monte Carlo method based QSAR modeling of maleimide derivatives as glycogen synthase kinase-3β inhibitors.基于蒙特卡罗方法的马来酰亚胺衍生物作为糖原合酶激酶-3β抑制剂的定量构效关系建模。
Comput Biol Med. 2015 Sep;64:276-82. doi: 10.1016/j.compbiomed.2015.07.004. Epub 2015 Jul 16.
7
Monte Carlo QSAR models for predicting organophosphate inhibition of acetycholinesterase.用于预测有机磷酸酯对乙酰胆碱酯酶抑制作用的蒙特卡罗定量构效关系模型。
SAR QSAR Environ Res. 2015 Jun;26(6):449-60. doi: 10.1080/1062936X.2015.1049665. Epub 2015 Jun 4.
8
QSAR models for HEPT derivates as NNRTI inhibitors based on Monte Carlo method.基于蒙特卡罗方法的作为非核苷类逆转录酶抑制剂的HEPT衍生物的定量构效关系模型。
Eur J Med Chem. 2014 Apr 22;77:298-305. doi: 10.1016/j.ejmech.2014.03.013. Epub 2014 Mar 11.
9
Design and development of novel focal adhesion kinase (FAK) inhibitors using Monte Carlo method with index of ideality of correlation to validate QSAR.使用相关理想指数的蒙特卡罗方法设计和开发新型粘着斑激酶 (FAK) 抑制剂以验证 QSAR。
SAR QSAR Environ Res. 2019 Feb;30(2):63-80. doi: 10.1080/1062936X.2018.1564067.
10
Monte Carlo Method Based QSAR Studies of Mer Kinase Inhibitors in Compliance with OECD Principles.基于蒙特卡洛方法的Mer激酶抑制剂定量构效关系研究:符合经合组织原则
Drug Res (Stuttg). 2018 Apr;68(4):189-195. doi: 10.1055/s-0043-119288. Epub 2017 Oct 9.

引用本文的文献

1
Using the Correlation Intensity Index to Build a Model of Cardiotoxicity of Piperidine Derivatives.利用相关强度指数构建哌啶衍生物心脏毒性模型。
Molecules. 2023 Sep 12;28(18):6587. doi: 10.3390/molecules28186587.
2
Do AutoML-Based QSAR Models Fulfill OECD Principles for Regulatory Assessment? A 5-HT Receptor Case.基于自动机器学习的定量构效关系模型是否符合经合组织监管评估原则?以5-羟色胺受体为例。
Pharmaceutics. 2022 Jul 6;14(7):1415. doi: 10.3390/pharmaceutics14071415.
3
Semi-correlations combined with the index of ideality of correlation: a tool to build up model of mutagenic potential.
半相关系数结合相关理想指数:建立诱变潜力模型的工具。
Mol Cell Biochem. 2019 Feb;452(1-2):133-140. doi: 10.1007/s11010-018-3419-4. Epub 2018 Aug 3.