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利用超过 801296 个小分子晶体结构来辅助蛋白质结构精修和分析。

Using more than 801 296 small-molecule crystal structures to aid in protein structure refinement and analysis.

机构信息

Cambridge Crystallographic Data Centre, 12 Union Road, Cambridge CB2 1EZ, England.

出版信息

Acta Crystallogr D Struct Biol. 2017 Mar 1;73(Pt 3):234-239. doi: 10.1107/S2059798316014352. Epub 2017 Feb 22.

Abstract

The Cambridge Structural Database (CSD) is the worldwide resource for the dissemination of all published three-dimensional structures of small-molecule organic and metal-organic compounds. This paper briefly describes how this collection of crystal structures can be used en masse in the context of macromolecular crystallography. Examples highlight how the CSD and associated software aid protein-ligand complex validation, and show how the CSD could be further used in the generation of geometrical restraints for protein structure refinement.

摘要

剑桥结构数据库 (CSD) 是全球范围内传播小分子有机和金属有机化合物所有已发表三维结构的资源。本文简要介绍了如何在大分子晶体学的背景下大规模使用这些晶体结构集合。示例突出显示了 CSD 及其相关软件如何帮助蛋白质-配体复合物的验证,并展示了 CSD 如何进一步用于蛋白质结构精修的几何约束的生成。

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