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C6的基因组序列草图,C6是一种参与种间代谢相互作用的环境分离株。

Draft Genome Sequence of C6, an Environmental Isolate Engaging in Interspecific Metabolic Interactions.

作者信息

Kaas Rolf Sommer, Mordhorst Hanne, Leekitcharoenphon Pimlapas, Dyring Jensen Jacob, Haagensen Janus A J, Molin Søren, Pamp Sünje Johanna

机构信息

Research Group for Genomic Epidemiology, Technical University of Denmark, Kongens Lyngby, Denmark.

Novo Nordisk Center for Biosustainability, Technical University of Denmark, Kongens Lyngby, Denmark.

出版信息

Genome Announc. 2017 Apr 20;5(16):e00155-17. doi: 10.1128/genomeA.00155-17.

DOI:10.1128/genomeA.00155-17
PMID:28428290
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5399249/
Abstract

C6 originates from creosote-polluted groundwater and performs ecological and evolutionary interactions with in biofilms. The draft genome of C6 is 3.7 Mbp and was shaped by mobile genetic elements. It reveals genes facilitating the biodegradation of aromatic hydrocarbons and resistance to antimicrobials and metals.

摘要

C6源自被杂酚油污染的地下水,并在生物膜中与……进行生态和进化相互作用。C6的基因组草图为370万碱基对,由移动遗传元件塑造而成。它揭示了有助于芳香烃生物降解以及对抗菌素和金属具有抗性的基因。