• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

通过构象无关的定量构效关系研究预测生物浓缩因子。

Predicting the bioconcentration factor through a conformation-independent QSPR study.

机构信息

a Instituto de Investigaciones Fisicoquímicas Teóricas y Aplicadas (INIFTA), CONICET, UNLP , La Plata , Argentina.

b Departamento de Química, Facultad de Ciencias Exactas y Naturales , Universidad de Belgrano , Buenos Aires , Argentina.

出版信息

SAR QSAR Environ Res. 2017 Sep;28(9):749-763. doi: 10.1080/1062936X.2017.1377765. Epub 2017 Oct 2.

DOI:10.1080/1062936X.2017.1377765
PMID:28965425
Abstract

The ANTARES dataset is a large collection of known and verified experimental bioconcentration factor data, involving 851 highly heterogeneous compounds from which 159 are pesticides. The BCF ANTARES data were used to derive a conformation-independent QSPR model. A large set of 27,017 molecular descriptors was explored, with the main intention of capturing the most relevant structural characteristics affecting the studied property. The structural descriptors were derived with different freeware tools, such as PaDEL, Epi Suite, CORAL, Mold, RECON, and QuBiLs-MAS, and so it was interesting to find out the way that the different descriptor tools complemented each other in order to improve the statistical quality of the established QSPR. The best multivariable linear regression models were found with the Replacement Method variable sub-set selection technique. The proposed QSPR model improves previous reported models of the bioconcentration factor in the present dataset.

摘要

ANTARES 数据集是一个大型的已知和经过验证的实验生物浓缩系数数据集合,涉及 851 种高度异构的化合物,其中 159 种是农药。BCF ANTARES 数据被用于推导出一个不依赖构象的 QSPR 模型。探索了一组包含 27017 个分子描述符的大型数据集,主要目的是捕捉影响所研究性质的最相关结构特征。结构描述符是使用不同的免费工具(如 PaDEL、Epi Suite、CORAL、Mold、RECON 和 QuBiLs-MAS)推导出来的,因此很有趣的是,找出不同描述符工具相互补充的方式,以提高所建立的 QSPR 的统计质量。最佳的多变量线性回归模型是使用替换方法变量子集选择技术找到的。所提出的 QSPR 模型改进了当前数据集生物浓缩系数的先前报告模型。

相似文献

1
Predicting the bioconcentration factor through a conformation-independent QSPR study.通过构象无关的定量构效关系研究预测生物浓缩因子。
SAR QSAR Environ Res. 2017 Sep;28(9):749-763. doi: 10.1080/1062936X.2017.1377765. Epub 2017 Oct 2.
2
Conformation-Independent QSPR Approach for the Soil Sorption Coefficient of Heterogeneous Compounds.非均相化合物土壤吸附系数的构象无关定量构效关系方法
Int J Mol Sci. 2016 Aug 3;17(8):1247. doi: 10.3390/ijms17081247.
3
The Use of the Index of Ideality of Correlation to Build Up Models for Bioconcentration Factor.运用相关理想指数,建立生物浓缩因子模型。
Mol Inform. 2020 Jul;39(7):e1900070. doi: 10.1002/minf.201900070. Epub 2020 Mar 13.
4
Linear Regression QSAR Models for Polo-Like Kinase-1 Inhibitors.针对类 polo 样激酶 -1 抑制剂的线性回归定量构效关系模型
Cells. 2018 Feb 14;7(2):13. doi: 10.3390/cells7020013.
5
The conformation-independent QSPR approach for predicting the oxidation rate constant of water micropollutants.构象无关的 QSPR 方法预测水中微量污染物的氧化速率常数。
Environ Sci Pollut Res Int. 2017 Dec;24(35):27366-27375. doi: 10.1007/s11356-017-0315-5. Epub 2017 Oct 3.
6
QSPR of the bioconcentration factors of non-ionic organic compounds in fish using extended topochemical atom (ETA) indices.使用扩展拓扑化学原子(ETA)指数对鱼类中非离子有机化合物生物富集因子的定量结构-性质关系研究
SAR QSAR Environ Res. 2006 Dec;17(6):563-82. doi: 10.1080/10629360601033499.
7
Highly diverse, massive organic data as explored by a composite QSPR strategy: an advanced study of boiling point.通过复合定量构效关系策略探索的高度多样、海量的有机数据:沸点的深入研究
SAR QSAR Environ Res. 2005 Jun;16(3):231-46. doi: 10.1080/10659360500037115.
8
QSPR modeling bioconcentration factor (BCF) by balance of correlations.通过相关性平衡进行生物富集因子(BCF)的定量构效关系建模
Eur J Med Chem. 2009 Jun;44(6):2544-51. doi: 10.1016/j.ejmech.2009.01.023. Epub 2009 Jan 31.
9
QSPR study on the bioconcentration factors of nonionic organic compounds in fish by characteristic root index and semiempirical molecular descriptors.基于特征根指数和半经验分子描述符的鱼类中非离子有机化合物生物富集因子的定量构效关系研究
J Chem Inf Comput Sci. 2004 May-Jun;44(3):985-92. doi: 10.1021/ci0342167.
10
QSPR model for bioconcentration factors of nonpolar organic compounds using molecular electronegativity distance vector descriptors.基于分子电性距离矢量描述符的非极性有机化合物生物浓缩因子定量构效关系模型。
Mol Divers. 2010 Feb;14(1):67-80. doi: 10.1007/s11030-009-9145-9. Epub 2009 Apr 15.

引用本文的文献

1
In silico local QSAR modeling of bioconcentration factor of organophosphate pesticides.有机磷农药生物富集因子的计算机辅助局部定量构效关系建模
In Silico Pharmacol. 2021 Apr 4;9(1):28. doi: 10.1007/s40203-021-00087-w. eCollection 2021.
2
A non-conformational QSAR study for plant-derived larvicides against Zika Aedes aegypti L. vector.一种针对植物源杀幼虫剂防治寨卡埃及伊蚊的非构象性 QSAR 研究。
Environ Sci Pollut Res Int. 2020 Feb;27(6):6205-6214. doi: 10.1007/s11356-019-06630-9. Epub 2019 Dec 21.
3
Statistical relationship between metabolic decomposition and chemical uptake predicts bioconcentration factor data for diverse chemical exposures.
代谢分解与化学物质摄取之间的统计关系可预测不同化学暴露情况下的生物浓缩因子数据。
BMC Syst Biol. 2018 Aug 7;12(1):81. doi: 10.1186/s12918-018-0601-y.
4
Linear Regression QSAR Models for Polo-Like Kinase-1 Inhibitors.针对类 polo 样激酶 -1 抑制剂的线性回归定量构效关系模型
Cells. 2018 Feb 14;7(2):13. doi: 10.3390/cells7020013.