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人类癌症中 TP53 基因为何存在热点突变?

Why are there hotspot mutations in the TP53 gene in human cancers?

机构信息

New York University, New York, NY, USA.

Cancer Institute of New Jersey, Rutgers University, New Brunswick, NJ, USA.

出版信息

Cell Death Differ. 2018 Jan;25(1):154-160. doi: 10.1038/cdd.2017.180. Epub 2017 Nov 3.

Abstract

The p53 gene contains homozygous mutations in ~50-60% of human cancers. About 90% of these mutations encode missense mutant proteins that span ~190 different codons localized in the DNA-binding domain of the gene and protein. These mutations produce a protein with a reduced capacity to bind to a specific DNA sequence that regulates the p53 transcriptional pathway. Eight of these mutations are localized in codons that account for ~28% of the total p53 mutations and these alleles appear to be selected for preferentially in human cancers of many tissue types. This article explores the question 'Why are there hotspot mutations in the p53 gene in human cancers?' Four possible reasons for this are considered; (1) the hotspot mutant alleles produce a protein that has a highly altered structure, (2) environmental mutagens produce allele-specific changes in the p53 gene, (3) these mutations arise at selected sites in the gene due to a specific DNA sequence, such as a methylated cytosine residue in a CpG dinucleotide, which has a higher mutation rate changing C to T nucleotides, (4) along with the observed change in mutant p53 proteins, which produce a loss of function (DNA binding and transcription), some mutant proteins have an allele-specific gain of function that promotes cancer. Evidence is presented that demonstrates the first three possibilities all contribute some property to this list of hotspot mutations. The fourth possibility remains to be tested.

摘要

p53 基因在大约 50-60%的人类癌症中存在纯合突变。这些突变约有 90%编码错义突变体蛋白,跨越基因和蛋白的 DNA 结合域中约 190 个不同的密码子。这些突变产生一种与特定 DNA 序列结合能力降低的蛋白,该序列调节 p53 转录途径。这些突变中有 8 个定位于占 p53 总突变约 28%的密码子,这些等位基因似乎在许多组织类型的人类癌症中被优先选择。本文探讨了“为什么在人类癌症中 p53 基因存在热点突变?”这一问题。考虑了出现这种情况的四个可能原因:(1)热点突变等位基因产生的蛋白结构高度改变;(2)环境诱变剂在 p53 基因中产生等位基因特异性变化;(3)这些突变由于特定的 DNA 序列,如 CpG 二核苷酸中甲基化的胞嘧啶残基,在基因中发生在选定的部位,其突变率更高,将 C 核苷酸改变为 T 核苷酸;(4)与观察到的突变 p53 蛋白的变化一起,产生功能丧失(DNA 结合和转录),一些突变蛋白具有等位基因特异性的获得功能,促进癌症。有证据表明,前三种可能性都为这组热点突变提供了一些特性。第四种可能性仍有待检验。

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