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从韩国分离出的一株感染[具体对象未给出]的菌株的全基因组序列。

Complete Genome Sequence of a Isolate from South Korea That Infects .

作者信息

Baek Dasom, Igori Davaajargal, Lim Seungmo, Hwang Un Sun, Choi Eung Kyoo, Moon Jae Sun

机构信息

Plant Systems Engineering Research Center, Korea Research Institute of Bioscience and Biotechnology, Daejeon, Republic of Korea.

Biosystems and Bioengineering Program, University of Science and Technology (UST), Daejeon, Republic of Korea.

出版信息

Genome Announc. 2017 Nov 30;5(48):e01289-17. doi: 10.1128/genomeA.01289-17.

DOI:10.1128/genomeA.01289-17
PMID:29192075
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC5722061/
Abstract

The complete genome sequence of a (PRSV) isolate from South Korea (SK) infecting squash () was obtained using paired-end RNA sequencing. A BLASTn search of the PRSV SK isolate full-genome sequence showed nucleotide sequence identity ranging from 81% to 83% with previously reported PRSV isolates (GenBank accession numbers KX655874 and EF017707).

摘要

利用双末端RNA测序获得了一株来自韩国(SK)感染南瓜(西葫芦)的番木瓜环斑病毒(PRSV)分离株的完整基因组序列。对PRSV SK分离株全基因组序列进行的BLASTn搜索显示,其核苷酸序列与先前报道的PRSV分离株(GenBank登录号KX655874和EF017707)的同一性在81%至83%之间。

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