• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

利用拟南芥信息资源库(TAIR)查找有关拟南芥基因的信息。

Using the Arabidopsis Information Resource (TAIR) to Find Information About Arabidopsis Genes.

作者信息

Reiser Leonore, Subramaniam Shabari, Li Donghui, Huala Eva

机构信息

Phoenix Bioinformatics, Fremont, California.

出版信息

Curr Protoc Bioinformatics. 2017 Dec 8;60:1.11.1-1.11.45. doi: 10.1002/cpbi.36.

DOI:10.1002/cpbi.36
PMID:29220077
Abstract

The Arabidopsis Information Resource (TAIR; http://arabidopsis.org) is a comprehensive Web resource of Arabidopsis biology for plant scientists. TAIR curates and integrates information about genes, proteins, gene function, orthologs, gene expression, mutant phenotypes, biological materials such as clones and seed stocks, genetic markers, genetic and physical maps, genome organization, images of mutant plants, protein sub-cellular localizations, publications, and the research community. The various data types are extensively interconnected and can be accessed through a variety of Web-based search and display tools. This unit primarily focuses on some basic methods for searching, browsing, visualizing, and analyzing information about Arabidopsis genes and genome. Additionally, we describe how members of the community can share data using TAIR's Online Annotation Submission Tool (TOAST), in order to make their published research more accessible and visible. © 2017 by John Wiley & Sons, Inc.

摘要

拟南芥信息资源库(TAIR;http://arabidopsis.org)是一个面向植物科学家的综合性拟南芥生物学网络资源库。TAIR整理并整合了有关基因、蛋白质、基因功能、直系同源基因、基因表达、突变体表型、生物材料(如克隆和种子库)、遗传标记、遗传图谱和物理图谱、基因组组织、突变体植物图像、蛋白质亚细胞定位、出版物以及研究群体等方面的信息。各种数据类型相互之间广泛关联,可通过多种基于网络的搜索和显示工具进行访问。本单元主要聚焦于一些搜索、浏览、可视化以及分析拟南芥基因和基因组信息的基本方法。此外,我们还描述了研究群体成员如何使用TAIR的在线注释提交工具(TOAST)来共享数据,以便使其已发表的研究成果更易于获取和展示。© 2017约翰威立国际出版公司

相似文献

1
Using the Arabidopsis Information Resource (TAIR) to Find Information About Arabidopsis Genes.利用拟南芥信息资源库(TAIR)查找有关拟南芥基因的信息。
Curr Protoc Bioinformatics. 2017 Dec 8;60:1.11.1-1.11.45. doi: 10.1002/cpbi.36.
2
Using the Arabidopsis Information Resource (TAIR) to Find Information About Arabidopsis Genes.利用拟南芥信息资源库(TAIR)查找有关拟南芥基因的信息。
Curr Protoc. 2022 Oct;2(10):e574. doi: 10.1002/cpz1.574.
3
Using the Arabidopsis information resource (TAIR) to find information about Arabidopsis genes.利用拟南芥信息资源(TAIR)查找有关拟南芥基因的信息。
Curr Protoc Bioinformatics. 2010 Jun;Chapter 1:1.11.1-1.11.51. doi: 10.1002/0471250953.bi0111s30.
4
Using the Arabidopsis Information Resource (TAIR) to find information about Arabidopsis genes.利用拟南芥信息资源库(TAIR)查找有关拟南芥基因的信息。
Curr Protoc Bioinformatics. 2005 Apr;Chapter 1:Unit 1.11. doi: 10.1002/0471250953.bi0111s9.
5
The Arabidopsis information resource: Making and mining the "gold standard" annotated reference plant genome.拟南芥信息资源:构建和挖掘“金标准”注释参考植物基因组。
Genesis. 2015 Aug;53(8):474-85. doi: 10.1002/dvg.22877. Epub 2015 Aug 4.
6
The Arabidopsis Information Resource (TAIR): gene structure and function annotation.拟南芥信息资源库(TAIR):基因结构与功能注释
Nucleic Acids Res. 2008 Jan;36(Database issue):D1009-14. doi: 10.1093/nar/gkm965. Epub 2007 Nov 5.
7
TAIR: a resource for integrated Arabidopsis data.TAIR:拟南芥综合数据资源库。
Funct Integr Genomics. 2002 Nov;2(6):239-53. doi: 10.1007/s10142-002-0077-z. Epub 2002 Oct 3.
8
The Arabidopsis Information Resource (TAIR): improved gene annotation and new tools.拟南芥信息资源(TAIR):改进的基因注释和新工具。
Nucleic Acids Res. 2012 Jan;40(Database issue):D1202-10. doi: 10.1093/nar/gkr1090. Epub 2011 Dec 2.
9
The TAIR database.TAIR数据库。
Methods Mol Biol. 2007;406:179-212. doi: 10.1007/978-1-59745-535-0_8.
10
The Arabidopsis Information Resource (TAIR): a model organism database providing a centralized, curated gateway to Arabidopsis biology, research materials and community.拟南芥信息资源库(TAIR):一个模式生物数据库,为拟南芥生物学、研究材料及相关群体提供集中的、经过整理的信息通道。
Nucleic Acids Res. 2003 Jan 1;31(1):224-8. doi: 10.1093/nar/gkg076.

引用本文的文献

1
An enhanced gene function analysis platform for Gastrodia Elata integrating further omics data and analysis tools.一种整合了更多组学数据和分析工具的天麻基因功能增强分析平台。
BMC Plant Biol. 2025 Aug 22;25(1):1111. doi: 10.1186/s12870-025-07173-7.
2
LoniComp: a platform for gene function comparison and analysis between Lonicera japonica and Lonicera macranthoides.LoniComp:一个用于金银花和大花忍冬之间基因功能比较与分析的平台。
BMC Genomics. 2025 Apr 1;26(1):328. doi: 10.1186/s12864-025-11507-y.
3
Arabidopsis research in 2030: Translating the computable plant.
2030年的拟南芥研究:转化可计算植物。
Plant J. 2025 Mar;121(5):e70047. doi: 10.1111/tpj.70047.
4
Genome-Wide Identification, Conservation, and Expression Pattern Analyses of the BBR-BPC Gene Family Under Abiotic Stress in L.番茄非生物胁迫下BBR - BPC基因家族的全基因组鉴定、保守性及表达模式分析
Genes (Basel). 2024 Dec 29;16(1):36. doi: 10.3390/genes16010036.
5
Confronting the data deluge: How artificial intelligence can be used in the study of plant stress.应对数据洪流:人工智能如何用于植物胁迫研究。
Comput Struct Biotechnol J. 2024 Sep 17;23:3454-3466. doi: 10.1016/j.csbj.2024.09.010. eCollection 2024 Dec.
6
Genome-Wide Identification and Molecular Evolutionary History of the Whirly Family Genes in .. 中Whirly家族基因的全基因组鉴定及分子进化史
Plants (Basel). 2024 Aug 13;13(16):2243. doi: 10.3390/plants13162243.
7
The Family in : Identification, Characterization, Evolution and Expression Profiles.《中的家族:鉴定、特征分析、进化及表达谱》
Molecules. 2024 Apr 17;29(8):1823. doi: 10.3390/molecules29081823.
8
Genome-wide identification of the bHLH transcription factor family in and response to low-temperature stress.在 中鉴定 bHLH 转录因子家族的全基因组及对低温胁迫的响应。
PeerJ. 2024 Jan 3;12:e16568. doi: 10.7717/peerj.16568. eCollection 2024.
9
Mining genes regulating root system architecture in maize based on data integration analysis.基于数据整合分析挖掘调控玉米根系结构的基因
Theor Appl Genet. 2023 May 15;136(6):127. doi: 10.1007/s00122-023-04376-0.
10
Deciphering Macromolecular Interactions Involved in Abiotic Stress Signaling: A Review of Bioinformatics Analysis.解析非生物胁迫信号传导中涉及的大分子相互作用:生物信息学分析综述
Methods Mol Biol. 2023;2642:257-294. doi: 10.1007/978-1-0716-3044-0_15.