• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

基于亚磺酸盐的 5-羟甲基胞嘧啶选择性标记:在生物素下拉实验中的应用。

Sulfinate Based Selective Labeling of 5-Hydroxymethylcytosine: Application to Biotin Pull Down Assay.

机构信息

Division of Chemistry and Biological Chemistry, School of Physical and Mathematical Sciences, Nanyang Technological University , 21 Nanyang Link, Singapore , 637371.

出版信息

Bioconjug Chem. 2018 Feb 21;29(2):245-249. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.7b00826. Epub 2018 Feb 2.

DOI:10.1021/acs.bioconjchem.7b00826
PMID:29382202
Abstract

We developed an enzyme-free, chemical method to selectively label the epigenetic base, 5-hydroxymethylcytosine (hmC) with versatile sulfinate reagents in aqueous solvent under mild reaction conditions. This method allows efficient single step conjugation of biotin to hmC site in DNA for enrichment and pull down assays.

摘要

我们开发了一种酶免化学方法,可在温和的反应条件下,以水溶性亚磺酸盐试剂选择性标记表观遗传碱基 5-羟甲基胞嘧啶(hmC)。该方法可在 DNA 的 hmC 位点上高效地进行一步生物素化反应,用于富集和拉下实验。

相似文献

1
Sulfinate Based Selective Labeling of 5-Hydroxymethylcytosine: Application to Biotin Pull Down Assay.基于亚磺酸盐的 5-羟甲基胞嘧啶选择性标记:在生物素下拉实验中的应用。
Bioconjug Chem. 2018 Feb 21;29(2):245-249. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.7b00826. Epub 2018 Feb 2.
2
Selective capture of 5-hydroxymethylcytosine from genomic DNA.从基因组DNA中选择性捕获5-羟甲基胞嘧啶
J Vis Exp. 2012 Oct 5(68):4441. doi: 10.3791/4441.
3
Selective chemical labeling reveals the genome-wide distribution of 5-hydroxymethylcytosine.选择性化学标记揭示了 5-羟甲基胞嘧啶在全基因组范围内的分布。
Nat Biotechnol. 2011 Jan;29(1):68-72. doi: 10.1038/nbt.1732. Epub 2010 Dec 12.
4
Mirror Bisulfite Sequencing: A Method for Single-Base Resolution of Hydroxymethylcytosine.焦磷酸测序:一种单碱基分辨率羟甲基胞嘧啶的方法。
Anal Chem. 2018 Nov 20;90(22):13200-13206. doi: 10.1021/acs.analchem.8b02832. Epub 2018 Nov 2.
5
Bioorthogonal labeling of 5-hydroxymethylcytosine in genomic DNA and diazirine-based DNA photo-cross-linking probes.基因组 DNA 中 5-羟甲基胞嘧啶的生物正交标记及重氮化物基 DNA 光交联探针
Acc Chem Res. 2011 Sep 20;44(9):709-17. doi: 10.1021/ar2000502. Epub 2011 May 3.
6
Development of the Bioluminescent Immunoassay for the Detection of 5-Hydroxymethylcytosine in Dinoflagellate.用于检测甲藻中5-羟甲基胞嘧啶的生物发光免疫分析方法的开发。
Anal Sci. 2019 Mar 10;35(3):301-305. doi: 10.2116/analsci.18P401. Epub 2018 Nov 9.
7
Electrochemical signal-amplified detection of 5-methylcytosine and 5-hydroxymethylcytosine in DNA using glucose modification coupled with restriction endonucleases.利用葡萄糖修饰物结合限制内切酶对 DNA 中的 5-甲基胞嘧啶和 5-羟甲基胞嘧啶进行电化学信号放大检测。
Analyst. 2018 Apr 30;143(9):2051-2056. doi: 10.1039/c7an02049j.
8
Sensitive and specific single-molecule sequencing of 5-hydroxymethylcytosine.5-羟甲基胞嘧啶的灵敏且特异的单分子测序。
Nat Methods. 2011 Nov 20;9(1):75-7. doi: 10.1038/nmeth.1779.
9
Quantifying mammalian genomic DNA hydroxymethylcytosine content using solid-state nanopores.使用固态纳米孔技术定量检测哺乳动物基因组 DNA 的 5-羟甲基胞嘧啶含量。
Sci Rep. 2016 Jul 7;6:29565. doi: 10.1038/srep29565.
10
Pull-down of 5-hydroxymethylcytosine DNA using JBP1-coated magnetic beads.使用 JBP1 涂层磁珠下拉 5-羟甲基胞嘧啶 DNA。
Nat Protoc. 2012 Jan 26;7(2):340-50. doi: 10.1038/nprot.2011.443.

引用本文的文献

1
Advantages and challenges associated with bisulfite-assisted nanopore direct RNA sequencing for modifications.亚硫酸氢盐辅助纳米孔直接RNA测序用于修饰的优势与挑战。
RSC Chem Biol. 2023 Aug 23;4(11):952-964. doi: 10.1039/d3cb00081h. eCollection 2023 Nov 1.
2
A novel fluorescent biosensor based on dendritic DNA nanostructure in combination with ligase reaction for ultrasensitive detection of DNA methylation.一种基于树状 DNA 纳米结构与连接酶反应的新型荧光生物传感器,用于超灵敏检测 DNA 甲基化。
J Nanobiotechnology. 2019 Dec 7;17(1):121. doi: 10.1186/s12951-019-0552-5.
3
Chemical Labeling and Affinity Capture of Inosine-Containing RNAs Using Acrylamidofluorescein.
使用丙烯酰胺荧光素对含次黄嘌呤的 RNA 进行化学标记和亲和捕获。
Bioconjug Chem. 2018 Sep 19;29(9):2899-2903. doi: 10.1021/acs.bioconjchem.8b00541. Epub 2018 Aug 27.