• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

基于有监督子空间投影的分类器集成进行分子活性预测。

Molecular activity prediction by means of supervised subspace projection based ensembles of classifiers.

机构信息

a Department of Computing and Numerical Analysis , University of Córdoba , Campus de Rabanales, Albert Einstein Building, Córdoba , Spain.

出版信息

SAR QSAR Environ Res. 2018 Mar;29(3):187-212. doi: 10.1080/1062936X.2017.1423376.

DOI:10.1080/1062936X.2017.1423376
PMID:29390886
Abstract

This paper proposes a method for molecular activity prediction in QSAR studies using ensembles of classifiers constructed by means of two supervised subspace projection methods, namely nonparametric discriminant analysis (NDA) and hybrid discriminant analysis (HDA). We studied the performance of the proposed ensembles compared to classical ensemble methods using four molecular datasets and eight different models for the representation of the molecular structure. Using several measures and statistical tests for classifier comparison, we observe that our proposal improves the classification results with respect to classical ensemble methods. Therefore, we show that ensembles constructed using supervised subspace projections offer an effective way of creating classifiers in cheminformatics.

摘要

本文提出了一种使用通过两种有监督子空间投影方法(即非参数判别分析(NDA)和混合判别分析(HDA))构建的分类器集进行 QSAR 研究中分子活性预测的方法。我们使用四个分子数据集和八种不同的分子结构表示模型,研究了与经典集成方法相比,所提出的集成方法的性能。通过使用多个分类器比较的度量和统计检验,我们观察到我们的方法相对于经典集成方法提高了分类结果。因此,我们表明,使用有监督子空间投影构建的集成提供了一种在化学信息学中创建分类器的有效方法。

相似文献

1
Molecular activity prediction by means of supervised subspace projection based ensembles of classifiers.基于有监督子空间投影的分类器集成进行分子活性预测。
SAR QSAR Environ Res. 2018 Mar;29(3):187-212. doi: 10.1080/1062936X.2017.1423376.
2
Ligand-based virtual screening and in silico design of new antimalarial compounds using nonstochastic and stochastic total and atom-type quadratic maps.基于配体的虚拟筛选以及使用非随机和随机全原子型及原子类型二次映射的新型抗疟化合物的计算机辅助设计。
J Chem Inf Model. 2005 Jul-Aug;45(4):1082-100. doi: 10.1021/ci050085t.
3
A nonparametric weighted feature extraction-based method for c-Jun N-terminal kinase-3 inhibitor prediction.一种基于非参数加权特征提取的c-Jun氨基末端激酶-3抑制剂预测方法。
J Mol Graph Model. 2019 Jul;90:235-242. doi: 10.1016/j.jmgm.2019.05.006. Epub 2019 May 11.
4
Using entropy of drug and protein graphs to predict FDA drug-target network: theoretic-experimental study of MAO inhibitors and hemoglobin peptides from Fasciola hepatica.利用药物和蛋白质网络图的熵预测 FDA 药物-靶标网络:单胺氧化酶抑制剂和来自 Fasciola hepatica 的血红蛋白肽的理论-实验研究。
Eur J Med Chem. 2011 Apr;46(4):1074-94. doi: 10.1016/j.ejmech.2011.01.023. Epub 2011 Jan 21.
5
Classification models for neocryptolepine derivatives as inhibitors of the β-haematin formation.新型隐丹参酮衍生物作为β-血红素形成抑制剂的分类模型。
Anal Chim Acta. 2011 Oct 31;705(1-2):98-110. doi: 10.1016/j.aca.2011.04.019. Epub 2011 Apr 20.
6
NL MIND-BEST: a web server for ligands and proteins discovery--theoretic-experimental study of proteins of Giardia lamblia and new compounds active against Plasmodium falciparum.NL MIND-BEST:一个用于配体和蛋白质发现的网络服务器——理论-实验研究蓝氏贾第鞭毛虫蛋白和新的抗疟化合物。
J Theor Biol. 2011 May 7;276(1):229-49. doi: 10.1016/j.jtbi.2011.01.010. Epub 2011 Jan 26.
7
First report on exploring classification and regression based QSAR modelling of Plasmodium falciparum glycogen synthase kinase (PfGSK-3) inhibitors.关于探索恶性疟原虫糖原合酶激酶(PfGSK - 3)抑制剂基于分类和回归的定量构效关系建模的首次报告。
SAR QSAR Environ Res. 2015;26(11):959-76. doi: 10.1080/1062936X.2015.1104518. Epub 2015 Nov 2.
8
Comprehensive ensemble in QSAR prediction for drug discovery.用于药物发现的 QSAR 预测的综合集成。
BMC Bioinformatics. 2019 Oct 26;20(1):521. doi: 10.1186/s12859-019-3135-4.
9
Pharmacophore-similarity-based QSAR (PS-QSAR) for group-specific biological activity predictions.基于药效团相似性的定量构效关系(PS-QSAR)用于特定基团生物活性预测。
J Biomol Struct Dyn. 2015;33(1):56-69. doi: 10.1080/07391102.2013.849618. Epub 2013 Nov 22.
10
Discovery of new potential hits of Plasmodium falciparum enoyl-ACP reductase through ligand- and structure-based drug design approaches.通过配体和基于结构的药物设计方法发现疟原虫烯酰基辅酶 A 还原酶的新潜在药物。
Bioorg Med Chem Lett. 2013 Apr 15;23(8):2436-41. doi: 10.1016/j.bmcl.2013.02.006. Epub 2013 Feb 13.

引用本文的文献

1
Influence of feature rankers in the construction of molecular activity prediction models.特征排序器对分子活性预测模型构建的影响。
J Comput Aided Mol Des. 2020 Mar;34(3):305-325. doi: 10.1007/s10822-019-00273-1. Epub 2019 Dec 31.
2
Boosted feature selectors: a case study on prediction P-gp inhibitors and substrates.增强型特征选择器:预测 P-糖蛋白抑制剂和底物的案例研究。
J Comput Aided Mol Des. 2018 Nov;32(11):1273-1294. doi: 10.1007/s10822-018-0171-5. Epub 2018 Oct 26.