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使用NanoString nCounter平台对脑膜炎奈瑟菌进行基因检测和表达谱分析。

Gene detection and expression profiling of Neisseria meningitidis using NanoString nCounter platform.

作者信息

Tekletsion Yenenesh K, Christensen Hannah, Finn Adam

机构信息

School of Cellular and Molecular Medicine, University of Bristol, BS8 1TD Bristol, UK.

Population Health Sciences, Bristol Medical School, University of Bristol, BS8 2BN Bristol, UK.

出版信息

J Microbiol Methods. 2018 Mar;146:100-103. doi: 10.1016/j.mimet.2018.02.003. Epub 2018 Feb 7.

DOI:10.1016/j.mimet.2018.02.003
PMID:29425856
Abstract

Detection of bacterial gene transcripts in low density mucosal samples is challenging. We evaluated the NanoString nCounter system for transcript detection in Neisseria meningitidis (Nm) cultures. The method was sensitive, reproducible (R = 0.99) and demonstrated changes in gene expression. Studying Nm transcripts from pharyngeal samples may be feasible using this approach.

摘要

在低密度黏膜样本中检测细菌基因转录本具有挑战性。我们评估了NanoString nCounter系统用于检测脑膜炎奈瑟菌(Nm)培养物中的转录本。该方法灵敏、可重复(R = 0.99),并显示出基因表达的变化。使用这种方法研究来自咽部样本的Nm转录本可能是可行的。

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引用本文的文献

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Infect Immun. 2021 Mar 17;89(4). doi: 10.1128/IAI.00715-20.