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基于鸟枪法宏基因组学探索食源性病原体生态学与抗菌药物耐药性

Exploring Foodborne Pathogen Ecology and Antimicrobial Resistance in the Light of Shotgun Metagenomics.

作者信息

Bridier Arnaud

机构信息

Fougères Laboratory, ANSES, Fougères, France.

出版信息

Methods Mol Biol. 2019;1918:229-245. doi: 10.1007/978-1-4939-9000-9_19.

DOI:10.1007/978-1-4939-9000-9_19
PMID:30580413
Abstract

In this chapter, applications of shotgun metagenomics for taxonomic profiling and functional investigation of food microbial communities with a focus on antimicrobial resistance (AMR) were overviewed in the light of last data in the field. Potentialities of metagenomic approach, along with the challenges encountered for a wider and routinely use in food safety was discussed.

摘要

在本章中，根据该领域的最新数据，概述了鸟枪法宏基因组学在食品微生物群落分类分析和功能研究中的应用，重点是抗菌药物耐药性（AMR）。讨论了宏基因组学方法的潜力，以及在食品安全领域更广泛和常规应用中遇到的挑战。

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