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pdb工具:分子结构的瑞士军刀。

pdb-tools: a swiss army knife for molecular structures.

作者信息

Rodrigues João P G L M, Teixeira João M C, Trellet Mikaël, Bonvin Alexandre M J J

机构信息

Structural Biology, Stanford University School of Medicine, Stanford, California, 94305, USA.

Independent Researcher, Salamanca, Spain.

出版信息

F1000Res. 2018 Dec 20;7:1961. doi: 10.12688/f1000research.17456.1. eCollection 2018.

Abstract

The pdb-tools are a collection of Python scripts for working with molecular structure data in the Protein Data Bank (PDB) format. They allow users to edit, convert, and validate PDB files, from the command-line, in a simple but efficient manner. The pdb-tools are implemented in Python, without any external dependencies, and are freely available under the open-source Apache License at https://github.com/haddocking/pdb-tools/ and on PyPI.

摘要

pdb工具是一组用于处理蛋白质数据库(PDB)格式分子结构数据的Python脚本。它们允许用户以简单而高效的方式从命令行编辑、转换和验证PDB文件。pdb工具用Python实现,无需任何外部依赖项,可在https://github.com/haddocking/pdb-tools/和PyPI上根据开源Apache许可证免费获取。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/0fe0/6343223/7eae876ea1f0/f1000research-7-19090-g0000.jpg

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