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从秘鲁临床病例中分离出的莱什曼原虫（维阿尼亚种）兰氏亚种216 - 34株的基因组序列初稿

First Draft Genome Sequence of Leishmania (Viannia) lainsoni Strain 216-34, Isolated from a Peruvian Clinical Case.

作者信息

Lin Wuling, Batra Dhwani, Narayanan Vidhya, Rowe Lori A, Sheth Mili, Zheng Yueli, Juieng Phalasy, Loparev Vladimir, de Almeida Marcos

机构信息

Reference Diagnostic Laboratory, Parasitic Diseases Branch/Department of Parasitic Diseases and Malaria, Centers for Disease Control and Prevention, Atlanta, Georgia, USA.

IHRC, Inc., Atlanta, Georgia, USA.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2019 Feb 7;8(6). doi: 10.1128/MRA.01524-18. eCollection 2019 Feb.

DOI:10.1128/MRA.01524-18
PMID:30746520
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC6368655/
Abstract

We present here the first draft genome sequence of Leishmania (Viannia) lainsoni strain 216-34, sequenced using PacBio and MiSeq platforms. PacBio contigs were generated from assemblies using CANU version 1.6 and polished using Illumina reads.

摘要

我们在此展示利什曼原虫（维阿尼亚种）兰氏利什曼原虫216 - 34株的基因组序列初稿，该序列使用PacBio和MiSeq平台进行测序。PacBio重叠群通过使用CANU 1.6版本进行组装生成，并使用Illumina reads进行抛光处理。

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