• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

miRandb:一个miRNA及其靶标的在线资源元数据库。

miRandb: A Metadatabase of Online Resources of miRNA and miRNA Targets.

作者信息

Aghaee-Bakhtiari Seyed Hamid

机构信息

Bioinformatics Research Center, Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Razavi Khorasan, Iran.

Department of Medical Biotechnology, Faculty of Medicine, Mashhad University of Medical Sciences, Mashhad, Razavi Khorasan, Iran.

出版信息

Methods Mol Biol. 2019;1970:15-30. doi: 10.1007/978-1-4939-9207-2_2.

DOI:10.1007/978-1-4939-9207-2_2
PMID:30963485
Abstract

MicroRNA (miRNA) studies deliver numerous types of information including miRNA identification, sequence of miRNAs, target prediction, roles in diseases, and interactions in signaling pathways. Considering the different types of miRNA data, the number of miRNA databases has been increasing quickly. While resources have been planned to simplify miRNA analysis, scientists are facing the challenging task of choosing the most proper tool to retrieve related information. In this chapter, we introduce the use of miRandb, a resource that we have established to present an outline of different types of miRNA online resources and to simplify finding the right miRNA information that scientists need for their research. miRandb offers a user-friendly platform to find related information about any miRNA data among more than 188 present miRNA databases. miRandb has an easy procedure, and information can be retrieved by miRNA category resources. Each database comprises numerous kinds of information including database activity, description, main and unique features, organism, URL, publication, category, published year, citations per year, last update, and relative popularity. miRandb provides several opportunities and facilitates access to diverse classes of microRNA resources. miRandb is available at http://miRandb.ir .

摘要

微小RNA(miRNA)研究提供了多种类型的信息,包括miRNA鉴定、miRNA序列、靶标预测、在疾病中的作用以及信号通路中的相互作用。考虑到miRNA数据的不同类型,miRNA数据库的数量一直在迅速增加。尽管已经计划了一些资源来简化miRNA分析,但科学家们仍面临着选择最合适工具来检索相关信息的艰巨任务。在本章中,我们介绍miRandb的使用,这是我们建立的一个资源,用于概述不同类型的miRNA在线资源,并简化科学家在研究中所需的正确miRNA信息的查找。miRandb提供了一个用户友好的平台,可在超过188个现有的miRNA数据库中查找有关任何miRNA数据的相关信息。miRandb操作简便,信息可通过miRNA类别资源进行检索。每个数据库都包含多种信息,包括数据库活动、描述、主要和独特特征、生物体、网址、出版物、类别、出版年份、每年引用次数、最后更新时间以及相对受欢迎程度。miRandb提供了多种机会,并便于访问各类微小RNA资源。可通过http://miRandb.ir访问miRandb。

相似文献

1
miRandb: A Metadatabase of Online Resources of miRNA and miRNA Targets.miRandb:一个miRNA及其靶标的在线资源元数据库。
Methods Mol Biol. 2019;1970:15-30. doi: 10.1007/978-1-4939-9207-2_2.
2
miRandb: a resource of online services for miRNA research.miRandb:一个 miRNA 研究在线服务资源。
Brief Bioinform. 2018 Mar 1;19(2):254-262. doi: 10.1093/bib/bbw109.
3
Web resources for microRNA research.miRNA 研究的网络资源。
Adv Exp Med Biol. 2013;774:225-50. doi: 10.1007/978-94-007-5590-1_12.
4
miRDB: an online database for prediction of functional microRNA targets.miRDB:一个用于预测功能 microRNA 靶标的在线数据库。
Nucleic Acids Res. 2020 Jan 8;48(D1):D127-D131. doi: 10.1093/nar/gkz757.
5
Computational prediction of microRNA targets.微小RNA靶标的计算预测
Methods Mol Biol. 2010;667:283-95. doi: 10.1007/978-1-60761-811-9_19.
6
Sfold Tools for MicroRNA Target Prediction.用于微小RNA靶标预测的Sfold工具
Methods Mol Biol. 2019;1970:31-42. doi: 10.1007/978-1-4939-9207-2_3.
7
PMRD: plant microRNA database.PMRD:植物 microRNA 数据库。
Nucleic Acids Res. 2010 Jan;38(Database issue):D806-13. doi: 10.1093/nar/gkp818. Epub 2009 Oct 6.
8
Obtaining miRNA-Target Interaction Information from miRWalk2.0.从miRWalk2.0获取miRNA-靶标相互作用信息。
Curr Protoc Bioinformatics. 2016 Sep 7;55:12.15.1-12.15.27. doi: 10.1002/cpbi.14.
9
Prediction of human microRNA targets.人类微小RNA靶标的预测
Methods Mol Biol. 2006;342:101-13. doi: 10.1385/1-59745-123-1:101.
10
miRWalk database for miRNA-target interactions.用于miRNA-靶标相互作用的miRWalk数据库。
Methods Mol Biol. 2014;1182:289-305. doi: 10.1007/978-1-4939-1062-5_25.

引用本文的文献

1
miRNAs in Heart Development and Disease.miRNAs 在心脏发育和疾病中的作用。
Int J Mol Sci. 2024 Jan 30;25(3):1673. doi: 10.3390/ijms25031673.
2
Systematics for types and effects of RNA variations.RNA 变异的类型和效应的系统分类学。
RNA Biol. 2021 Apr;18(4):481-498. doi: 10.1080/15476286.2020.1817266. Epub 2020 Sep 20.