• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

已知生命形式之间的进化关系。

The evolutionary relationships among known life forms.

作者信息

Cedergren R, Gray M W, Abel Y, Sankoff D

机构信息

Department de biochimie, Université de Montréal, Québec, Canada.

出版信息

J Mol Evol. 1988;28(1-2):98-112. doi: 10.1007/BF02143501.

DOI:10.1007/BF02143501
PMID:3148747
Abstract

Sequences of small subunit (SSU) and large subunit (LSU) ribosomal RNA genes from archaebacteria, eubacteria, and the nucleus, chloroplasts, and mitochondria of eukaryotes have been compared in order to identify the most conservative positions. Aligned sets of these positions for both SSU and LSU rRNA have been used to generate tree diagrams relating the source organisms/organelles. Branching patterns were evaluated using the statistical bootstrapping technique. The resulting SSU and LSU trees are remarkably congruent and show a high degree of similarity with those based on alternative data sets and/or generated by different techniques. In addition to providing insights into the evolution of prokaryotic and eukaryotic (nuclear) lineages, the analysis reported here provides, for the first time, an extensive phylogeny of the mitochondrial lineage.

摘要

为了确定最保守的位置,对古细菌、真细菌以及真核生物的细胞核、叶绿体和线粒体的小亚基(SSU)和大亚基(LSU)核糖体RNA基因序列进行了比较。已使用这些SSU和LSU rRNA的对齐位置集来生成与源生物/细胞器相关的树形图。使用统计自展技术评估分支模式。所得的SSU和LSU树非常一致,并且与基于替代数据集和/或由不同技术生成的树具有高度相似性。除了深入了解原核生物和真核生物(核)谱系的进化外,本文报道的分析首次提供了线粒体谱系的广泛系统发育。

相似文献

1
The evolutionary relationships among known life forms.已知生命形式之间的进化关系。
J Mol Evol. 1988;28(1-2):98-112. doi: 10.1007/BF02143501.
2
Evolution according to large ribosomal subunit RNA.基于大核糖体亚基RNA的进化
J Mol Evol. 1995 Sep;41(3):366-75. doi: 10.1007/BF01215184.
3
Evaluating hypotheses of deuterostome phylogeny and chordate evolution with new LSU and SSU ribosomal DNA data.利用新的大亚基和小亚基核糖体DNA数据评估后口动物系统发育和脊索动物进化的假说。
Mol Biol Evol. 2002 May;19(5):762-76. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a004134.
4
Phylogenetic relationships among algae based on complete large-subunit rRNA sequences.基于完整的大亚基rRNA序列的藻类系统发育关系。
Int J Syst Evol Microbiol. 2001 May;51(Pt 3):737-749. doi: 10.1099/00207713-51-3-737.
5
Phylogeny of the photosynthetic euglenophytes inferred from the nuclear SSU and partial LSU rDNA.基于细胞核小亚基和部分大亚基核糖体DNA推断光合裸藻的系统发育
Int J Syst Evol Microbiol. 2003 Jul;53(Pt 4):1175-1186. doi: 10.1099/ijs.0.02518-0.
6
The ribosomal RNA gene region in Acanthamoeba castellanii mitochondrial DNA. A case of evolutionary transfer of introns between mitochondria and plastids?卡氏棘阿米巴线粒体DNA中的核糖体RNA基因区域。线粒体与质体之间内含子发生进化转移的一个实例?
J Mol Biol. 1994 Jun 17;239(4):476-99. doi: 10.1006/jmbi.1994.1390.
7
Characterization of the nuclear large-subunit rRNA-encoding gene and the group-I self-splicing intron from Chlorella ellipsoidea C-87.椭圆小球藻C-87核大核糖体亚基rRNA编码基因及I类自剪接内含子的特性分析
Gene. 1994 Jul 22;145(1):139-44. doi: 10.1016/0378-1119(94)90337-9.
8
Phylogenetic position of foraminifera inferred from LSU rRNA gene sequences.基于 LSU rRNA 基因序列推断有孔虫的系统发育位置。
Mol Biol Evol. 1994 Nov;11(6):929-38. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a040174.
9
Evolution of RNA editing sites in the mitochondrial small subunit rRNA of the Myxomycota.黏菌线粒体小亚基rRNA中RNA编辑位点的进化
Methods Enzymol. 2007;424:197-220. doi: 10.1016/S0076-6879(07)24009-1.
10
Testing the new animal phylogeny: first use of combined large-subunit and small-subunit rRNA gene sequences to classify the protostomes.检验新的动物系统发生:首次使用大亚基和小亚基核糖体RNA基因序列的组合对原口动物进行分类。
Mol Biol Evol. 2002 Mar;19(3):289-301. doi: 10.1093/oxfordjournals.molbev.a004082.

引用本文的文献

1
Metabolic reprogramming: a bridge between aging and tumorigenesis.代谢重编程:衰老与肿瘤发生之间的桥梁。
Mol Oncol. 2022 Sep;16(18):3295-3318. doi: 10.1002/1878-0261.13261. Epub 2022 Jun 19.
2
Mitochondria as a Cellular Hub in Infection and Inflammation.线粒体作为感染和炎症中的细胞枢纽
Int J Mol Sci. 2021 Oct 20;22(21):11338. doi: 10.3390/ijms222111338.
3
: Host Range and Advance in Molecular Identification Techniques.宿主范围与分子鉴定技术进展

本文引用的文献

1
CONFIDENCE LIMITS ON PHYLOGENIES: AN APPROACH USING THE BOOTSTRAP.系统发育树的置信区间:一种使用自展法的方法。
Evolution. 1985 Jul;39(4):783-791. doi: 10.1111/j.1558-5646.1985.tb00420.x.
2
Nucleotide sequence of the soybean mitochondrial 18S rRNA gene: evidence for a slow rate of divergence in the plant mitochondrial genome.大豆线粒体 18S rRNA 基因的核苷酸序列:植物线粒体基因组中分化缓慢的证据。
Plant Mol Biol. 1985 Mar;5(2):119-24. doi: 10.1007/BF00020094.
3
Dinoflagellate 17S rRNA sequence inferred from the gene sequence: Evolutionary implications.
Front Plant Sci. 2017 Jun 8;8:944. doi: 10.3389/fpls.2017.00944. eCollection 2017.
4
Organelle evolution, fragmented rRNAs, and Carl.细胞器进化、断裂的 rRNA 与卡尔。
RNA Biol. 2014;11(3):213-6. doi: 10.4161/rna.27799. Epub 2014 Feb 6.
5
Movement of DNA across the chloroplast envelope: Implications for the transfer of promiscuous DNA.DNA 在叶绿体被膜间的运动:对转座 DNA 转移的启示。
Photosynth Res. 1995 Nov;46(1-2):329-37. doi: 10.1007/BF00020448.
6
Mitochondrial evolution.线粒体进化。
Cold Spring Harb Perspect Biol. 2012 Sep 1;4(9):a011403. doi: 10.1101/cshperspect.a011403.
7
Differentiation of petroleum hydrocarbon-degrading Pseudomonas spp. based on PCR-RFLP of the 16S-23S rDNA intergenic spacer region.基于 16S-23S rDNA 基因间隔区 PCR-RFLP 对石油烃降解假单胞菌的分类。
Folia Microbiol (Praha). 2012 Jan;57(1):47-52. doi: 10.1007/s12223-011-0088-z. Epub 2011 Dec 23.
8
Diversity of 23S rRNA genes within individual prokaryotic genomes.单个原核生物基因组内23S rRNA基因的多样性。
PLoS One. 2009;4(5):e5437. doi: 10.1371/journal.pone.0005437. Epub 2009 May 5.
9
On the evolutionary origin of the plant mitochondrion and its genome.植物线粒体及其基因组的进化起源。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1989 Apr;86(7):2267-71. doi: 10.1073/pnas.86.7.2267.
10
Phylogenetic relationships of Xylella fastidiosa strains based on 16S-23S rDNA sequences.基于16S-23S核糖体DNA序列的桑萎蔫病菌株的系统发育关系。
Curr Microbiol. 2005 Apr;50(4):190-5. doi: 10.1007/s00284-004-4405-5. Epub 2005 Mar 21.
从基因序列推断出的甲藻 17S rRNA 序列:进化意义。
Proc Natl Acad Sci U S A. 1986 Nov;83(22):8644-8. doi: 10.1073/pnas.83.22.8644.
4
Multiple spacer sequences in the nuclear large subunit ribosomal RNA gene of Crithidia fasciculata.法菲毛滴虫核大亚基核糖体 RNA 基因中的多个间隔序列。
EMBO J. 1987 Apr;6(4):1063-71. doi: 10.1002/j.1460-2075.1987.tb04859.x.
5
Archaebacterial phylogeny: perspectives on the urkingdoms.古细菌系统发育:关于原始界的观点。
Syst Appl Microbiol. 1986;7:161-77. doi: 10.1016/s0723-2020(86)80001-7.
6
Gram-positive bacteria: possible photosynthetic ancestry.革兰氏阳性菌:可能的光合起源。
Science. 1985;229:762-5. doi: 10.1126/science.11539659.
7
Precise localization and nucleotide sequence of the two mouse mitochondrial rRNA genes and three immediately adjacent novel tRNA genes.两个小鼠线粒体rRNA基因以及三个紧邻的新tRNA基因的精确定位和核苷酸序列。
Cell. 1980 Nov;22(1 Pt 1):157-70. doi: 10.1016/0092-8674(80)90164-6.
8
The primary and secondary structure of yeast 26S rRNA.酵母26S核糖体RNA的一级和二级结构。
Nucleic Acids Res. 1981 Dec 21;9(24):6935-52. doi: 10.1093/nar/9.24.6935.
9
Primary sequence of wheat mitochondrial 5S ribosomal ribonucleic acid: functional and evolutionary implications.小麦线粒体5S核糖体核糖核酸的一级序列:功能及进化意义
Biochemistry. 1981 Jul 7;20(14):4022-9. doi: 10.1021/bi00517a011.
10
Complete sequence of bovine mitochondrial DNA. Conserved features of the mammalian mitochondrial genome.牛线粒体DNA的完整序列。哺乳动物线粒体基因组的保守特征。
J Mol Biol. 1982 Apr 25;156(4):683-717. doi: 10.1016/0022-2836(82)90137-1.