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从酸性矿山排水中分离得到的嗜铁酸性氧化硫硫杆菌JAGS的全基因组序列

Complete Genome Sequence of Acidithiobacillus ferridurans JAGS, Isolated from Acidic Mine Drainage.

作者信息

Chen Jinjin, Liu Yilan, Diep Patrick, Jo Andrew, Nesbø Camilla, Edwards Elizabeth, Papangelakis Vladimiros, Mahadevan Radhakrishnan

机构信息

Department of Chemical Engineering and Applied Chemistry, University of Toronto, Toronto, Canada.

Department of Biological Sciences, University of Alberta Edmonton, Alberta, Canada.

出版信息

Microbiol Resour Announc. 2020 Mar 26;9(13):e00033-20. doi: 10.1128/MRA.00033-20.

DOI:10.1128/MRA.00033-20
PMID:32217670
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7098893/
Abstract

We report a complete genome sequence of JAGS, determined using PacBio single-molecule real-time (SMRT) sequencing. The circular genome of JAGS (2,933,811 bp; GC content, 58.57%) contains 3,001 protein-coding sequences, 46 tRNAs, and 6 rRNAs. Predicted genes indicate the potential to fix CO and N and to utilize Fe, S, and H as energy sources.

摘要

我们报告了使用PacBio单分子实时(SMRT)测序确定的JAGS完整基因组序列。JAGS的环状基因组(2,933,811 bp;GC含量为58.57%)包含3,001个蛋白质编码序列、46个tRNA和6个rRNA。预测基因显示了固定CO和N以及利用Fe、S和H作为能源的潜力。

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