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.的完整叶绿体基因组

Complete chloroplast genome of .

作者信息

Park Inkyu, Choi Goya, Yang Sungyu

机构信息

Herbal Medicine Research Division, Korea Institute of Oriental Medicine, Naju, Republic of Korea.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 13;5(1):304-305. doi: 10.1080/23802359.2019.1698993.

DOI:10.1080/23802359.2019.1698993
PMID:33366531
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7748843/
Abstract

roots are used as a medicinal herb. To ensure the accurate identification of , we sequenced its chloroplast genome using the Illumina MiSeq platform. Results showed that the chloroplast genome of is 159,102 bp in size, with a large single-copy (LSC) region (85,456 bp), a small single-copy (SSC) region (17,108 bp), and two inverted repeat (IR) regions (IRa and IRb; 28,269 bp each). Additionally, the chloroplast genome contains 112 unique genes, including 78 protein-coding, four ribosomal RNA, and 30 transfer RNA genes. Phylogenetic analysis revealed that is most closely related to .

摘要

其根被用作草药。为确保对其进行准确鉴定,我们使用Illumina MiSeq平台对其叶绿体基因组进行了测序。结果表明,其叶绿体基因组大小为159,102 bp,具有一个大单拷贝(LSC)区域(85,456 bp)、一个小单拷贝(SSC)区域(17,108 bp)以及两个反向重复(IR)区域(IRa和IRb;各28,269 bp)。此外,叶绿体基因组包含112个独特基因,包括78个蛋白质编码基因、4个核糖体RNA基因和30个转运RNA基因。系统发育分析表明,其与……关系最为密切。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8df/7748843/25e0c7600f84/TMDN_A_1698993_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a8df/7748843/25e0c7600f84/TMDN_A_1698993_F0001_B.jpg
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