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唇形科观赏植物薄荷(Mentha haplocalyx Briq.)的完整叶绿体基因组序列

The complete chloroplast genome sequence retz., an ornamental plant of Lamiaceae.

作者信息

Lee Yoonkyung, Kim Sangtae

机构信息

Department of Biology, Sungshin Women's University, Seoul, Korea.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jan 27;5(1):895-896. doi: 10.1080/23802359.2020.1717392.

DOI:10.1080/23802359.2020.1717392
PMID:33366801
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7748846/
Abstract

Retz. (Lamiaceae) is a widely cultivated ornamental plant. As a first report in the genus, we present the complete chloroplast genome sequence of using genome skimming of paired-end NGS data. The total genome size measures 153,273 bp in length containing four subregions: 84,693 bp of large single-copy region, 17,330 bp small single-copy region, and a pair of inverted repeat regions, measuring 25,625 bp. The genome contains 115 genes including 80 protein-coding genes, 4 rRNAs, and 31 tRNAs. Phylogenetic analysis showed that is a sister to in the subfamily Scutellarioideae of Lamiaceae.

摘要

Retz.(唇形科)是一种广泛种植的观赏植物。作为该属的首次报道,我们通过对双端NGS数据进行基因组鸟枪法测序,呈现了[植物名称未给出]的完整叶绿体基因组序列。基因组全长153,273 bp,包含四个亚区域:84,693 bp的大单拷贝区域、17,330 bp的小单拷贝区域以及一对长度为25,625 bp的反向重复区域。该基因组包含115个基因,其中包括80个蛋白质编码基因、4个rRNA和31个tRNA。系统发育分析表明,[植物名称未给出]是唇形科黄芩亚科中[另一植物名称未给出]的姐妹种。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3a4/7748846/052226c00a25/TMDN_A_1717392_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/a3a4/7748846/052226c00a25/TMDN_A_1717392_F0001_B.jpg
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