• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

来自中国重庆的一种观赏兼药用植物(唇形目,唇形科)的完整叶绿体基因组。

The complete chloroplast genome of (Lamiales, Lamiaceae), an ornamental and medicinal plant from Chongqing, China.

作者信息

Wang Chao-Ying, Luo Ji-Hong, He Hui-Liu, Wang Qian

机构信息

Chongqing City Management College, Chongqing, China.

Chongqing Key Laboratory of Plant Resource Conservation and Germplasm Innovation, Institute of Resources Botany, School of Life Sciences, Southwest University, Chongqing, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 24;6(3):1229-1230. doi: 10.1080/23802359.2021.1875932.

DOI:10.1080/23802359.2021.1875932
PMID:33796788
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7995876/
Abstract

Plants classified to the genus L. have important medicinal and ornamental value. Here, we report and characterize the complete chloroplast (cp) genome of to provide molecular basis for the further studies on the phylogeny analysis of this genus. The cp genome is 154,183 bp in length and is organized with a typical quadripartite structure, containing two inverted repeats of 25,701 bp separated by a large single-copy region of 84,956 bp and a small single-copy region of 17,825 bp. The cp genome of contains 112 distinct genes, including 78 protein-coding, 30 tRNAs and 4 rRNAs genes. The phylogenetic analysis showed that is fully resolved in a clade with , sister to the clade of and var. .

摘要

分类为L.属的植物具有重要的药用和观赏价值。在此,我们报道并表征了[植物名称]的完整叶绿体(cp)基因组,为该属系统发育分析的进一步研究提供分子基础。该cp基因组长度为154,183 bp,具有典型的四分体结构,包含两个25,701 bp的反向重复序列,被一个84,956 bp的大单拷贝区域和一个17,825 bp的小单拷贝区域隔开。[植物名称]的cp基因组包含112个不同的基因,包括78个蛋白质编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因。系统发育分析表明,[植物名称]在一个分支中与[另一植物名称]完全聚类,是[另外两个植物名称分支]分支的姐妹分支。

相似文献

1
The complete chloroplast genome of (Lamiales, Lamiaceae), an ornamental and medicinal plant from Chongqing, China.来自中国重庆的一种观赏兼药用植物(唇形目,唇形科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 24;6(3):1229-1230. doi: 10.1080/23802359.2021.1875932.
2
The complete chloroplast genome of Lamk. var. Schauer (Lamiaceae).紫苏(唇形科)变种肖尔的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Nov 23;6(12):3473-3474. doi: 10.1080/23802359.2021.2002210. eCollection 2021.
3
The complete chloroplast genome of Lindl. (Lamiaceae) from Guangxi, China: genome structure and phylogenetic analysis.中国广西唇形科植物石蚕叶香茶菜(Lindl.)的完整叶绿体基因组:基因组结构与系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Oct 23;6(11):3280-3282. doi: 10.1080/23802359.2021.1993106. eCollection 2021.
4
Complete chloroplast genome of Rolfe, a famous ornamental plant and traditional medicinal herb.著名观赏植物和传统草药罗氏石斛的完整叶绿体基因组
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Sep 21;5(3):3383-3384. doi: 10.1080/23802359.2020.1820399.
5
The complete chloroplast genome of var. (Lamiaceae) from Guilin, China, a potential medicinal plant.来自中国桂林的一种潜在药用植物——唇形科[植物名称]变种的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Aug 27;6(9):2779-2780. doi: 10.1080/23802359.2021.1969696. eCollection 2021.
6
The complete chloroplast genome of Levl. and its phylogenetic position.勒夫(Levl.)的完整叶绿体基因组及其系统发育位置。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 18;6(3):1022-1024. doi: 10.1080/23802359.2021.1895000.
7
The complete chloroplast genome sequence of the medicinal plant Salvia miltiorrhiza.药用植物丹参的完整叶绿体基因组序列。
PLoS One. 2013;8(2):e57607. doi: 10.1371/journal.pone.0057607. Epub 2013 Feb 27.
8
The complete chloroplast genome sequence of the medicinal plant var. (Lamiaceae).药用植物紫苏变种(唇形科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Sep 18;4(2):3055-3056. doi: 10.1080/23802359.2019.1666675.
9
The complete chloroplast genome of Metcalf (Lamiaceae) from Fujian Province, China: genome structure and phylogenetic analysis.中国福建省薄荷属(唇形科)植物的叶绿体全基因组:基因组结构与系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 May 17;6(5):1634-1635. doi: 10.1080/23802359.2021.1926364.
10
The complete chloroplast genome of (Lamiaceae), an endemic species from China.唇形科一种中国特有物种的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jun 24;5(3):2568-2570. doi: 10.1080/23802359.2020.1781562.

引用本文的文献

1
The complete chloroplast genome of (Lour.) K.Koch (Lamiaceae).(唇形科)罗勒(Lour.)K.Koch的完整叶绿体基因组
Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Nov 1;8(11):1174-1178. doi: 10.1080/23802359.2023.2275332. eCollection 2023.
2
The complete chloroplast genome of Lamk. var. Schauer (Lamiaceae).紫苏(唇形科)变种肖尔的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Nov 23;6(12):3473-3474. doi: 10.1080/23802359.2021.2002210. eCollection 2021.
3
The complete chloroplast genome of Lindl. (Lamiaceae) from Guangxi, China: genome structure and phylogenetic analysis.

本文引用的文献

1
Evolutionary and phylogenetic aspects of the chloroplast genome of Chaenomeles species.山荆子属叶绿体基因组的进化和系统发育分析。
Sci Rep. 2020 Jul 10;10(1):11466. doi: 10.1038/s41598-020-67943-1.
2
PGA: a software package for rapid, accurate, and flexible batch annotation of plastomes.PGA:一个用于叶绿体基因组快速、准确且灵活批量注释的软件包。
Plant Methods. 2019 May 21;15:50. doi: 10.1186/s13007-019-0435-7. eCollection 2019.
3
A large-scale chloroplast phylogeny of the Lamiaceae sheds new light on its subfamilial classification.
中国广西唇形科植物石蚕叶香茶菜(Lindl.)的完整叶绿体基因组:基因组结构与系统发育分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Oct 23;6(11):3280-3282. doi: 10.1080/23802359.2021.1993106. eCollection 2021.
大规模唇形科叶绿体系统发育研究对其亚科分类提出了新的见解。
Sci Rep. 2016 Oct 17;6:34343. doi: 10.1038/srep34343.
4
RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies.RAxML 版本 8:用于系统发育分析和大型系统发育后分析的工具。
Bioinformatics. 2014 May 1;30(9):1312-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btu033. Epub 2014 Jan 21.
5
MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability.MAFFT 多序列比对软件版本 7:性能和易用性的改进。
Mol Biol Evol. 2013 Apr;30(4):772-80. doi: 10.1093/molbev/mst010. Epub 2013 Jan 16.
6
SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing.SPAdes:一种新的基因组组装算法及其在单细胞测序中的应用
J Comput Biol. 2012 May;19(5):455-77. doi: 10.1089/cmb.2012.0021. Epub 2012 Apr 16.