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在通向有效蛋白质-蛋白质相互作用调节剂的道路上,非肽 α-螺旋类似物的进化。

Evolution in non-peptide α-helix mimetics on the road to effective protein-protein interaction modulators.

机构信息

Instituto de Química Médica, IQM-CSIC, Juan de La Cierva 3, 28006, Madrid, Spain.

Instituto de Química Médica, IQM-CSIC, Juan de La Cierva 3, 28006, Madrid, Spain.

出版信息

Eur J Med Chem. 2021 Feb 5;211:113015. doi: 10.1016/j.ejmech.2020.113015. Epub 2020 Nov 12.

DOI:10.1016/j.ejmech.2020.113015
PMID:33423841
Abstract

Modulation of interactome networks, essentially protein-protein interactions (PPIs), might represent valuable therapeutic approaches to different pathological conditions. Since a high percentage of PPIs are mediated by α-helical structures at the interacting surface, the development of compounds able to reproduce the amino acid side-chain organization of α-helices (e.g. stabilized α-helix peptides and β-derivatives, proteomimetics, and α-helix small-molecule mimetics) focuses the attention of different research groups. This appraisal describes the recent progress in the non-peptide α-helix mimetics field, which has evolved from single-face to multi-face reproducing compounds and from oligomeric to monomeric scaffolds able to bear different substituents in similar spatial dispositions as the side-chains in canonical helices. Grouped by chemical structures, the review contemplates terphenyl-like molecules, oligobenzamides and heterocyclic analogues, benzamide-amino acid conjugates and non-oligomeric small-molecules mimetics, among others, and their effectiveness to stabilize/disrupt therapeutically relevant PPIs. The X-ray structures of a couple of oligomeric peptidomimetics and of some small-molecules complexed with the MDM2 protein, as well as the state of the art on their development in clinical trials, are also remarked. The discovery of a continuously increasing number of new disease-relevant PPIs could offer future opportunities for these and other forthcoming α-helix mimetics.

摘要

互作网络(主要是蛋白质-蛋白质相互作用,PPIs)的调节可能代表了针对不同病理状况的有价值的治疗方法。由于相互作用表面的 PPIs 有很大一部分是由α-螺旋结构介导的,因此开发能够重现α-螺旋氨基酸侧链结构的化合物(例如稳定的α-螺旋肽和β衍生物、拟肽和α-螺旋小分子模拟物)引起了不同研究小组的关注。这篇评价描述了非肽类α-螺旋模拟物领域的最新进展,该领域已经从单面对映体发展到多面对映体复制化合物,从寡聚体到单体支架,能够以与经典螺旋中侧链相似的空间排列承载不同的取代基。根据化学结构分组,综述考虑了联苯类分子、寡苯甲酰胺和杂环类似物、苯甲酰胺-氨基酸缀合物和非寡聚小分子模拟物等,以及它们稳定/破坏治疗相关 PPIs 的效果。还提到了一对寡肽模拟物和一些与 MDM2 蛋白结合的小分子的 X 射线结构,以及它们在临床试验中的最新开发情况。不断发现新的与疾病相关的 PPIs 可能为这些和其他即将出现的α-螺旋模拟物提供未来的机会。

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