Suppr超能文献

智利特有蛙类福尔马斯、奎瓦斯和努涅斯(2006年)(无尾目,雨蛙科)的完整线粒体基因组

The complete mitochondrial genome of the Chilean endemic frog Formas, Cuevas & Nuñez, 2006 (Anura, Telmatobiidae).

作者信息

Pastenes Luis, Valdivieso Camilo, Del Pozo Talía, Méndez Marco A

机构信息

Laboratorio de Genética y Evolución, Departamento de Ciencias Ecológicas, Facultad de Ciencias, Universidad de Chile, Santiago, Chile.

Laboratorio de Bioinformática y Expresión Génica, INTA, Universidad de Chile, Santiago, Chile.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2016 Mar 28;1(1):136-137. doi: 10.1080/23802359.2016.1144097.

Abstract

is an endemic frog of northern Chile that is only known at its type locality, Chusmisa. In this study, the complete mitochondrial genome of was assembled using high-throughput sequencing data, yielding a circular genome of 19 312 bp with a nucleotide composition of A = 30.8%, C = 24.4%, G = 13.6% and T = 31.2%. Its gene composition and structure were similar to other anuran genomes available: 13 protein-coding genes, two rRNA genes, 22 tRNA genes and the D-loop region. Phylogenetic analysis using Bayesian inference (BI) and maximum likelihood (ML) showed that , and are a highly supported monophyletic group. This genome information will allow us to gain a better understanding into phylogenetic and phylogeographic relationships in the genus .

摘要

是智利北部的一种特有蛙类,仅在其模式产地丘斯米萨被发现。在本研究中,利用高通量测序数据组装了该蛙的完整线粒体基因组,得到一个19312 bp的环状基因组,核苷酸组成为A = 30.8%、C = 24.4%、G = 13.6%和T = 31.2%。其基因组成和结构与其他已有的无尾目基因组相似:13个蛋白质编码基因、2个rRNA基因、22个tRNA基因和D环区域。使用贝叶斯推断(BI)和最大似然法(ML)进行的系统发育分析表明,[具体物种名1]、[具体物种名2]和[具体物种名3]是一个得到高度支持的单系类群。这些基因组信息将使我们能够更好地了解该属的系统发育和系统地理学关系。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/20b3/7800222/4048985005d8/TMDN_A_1144097_F0001_B.jpg

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验