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中国市场上一个商业品种的完整线粒体基因组及其遗传关系评估。

The complete mitogenome of one commercial cultivar in Chinese market and its evaluation of genetic relationship.

作者信息

Liu Xiangxiang, Li Jun, Chang Chuangang, Zhang Jing

机构信息

Qilu University of Technology (Shandong Academy of Sciences), Jinan, Shandong Province, People's Republic of China.

Shandong International Fisheries Corp, Jinan, Shandong Province, People's Republic of China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2018 May 15;3(2):590-591. doi: 10.1080/23802359.2018.1473736.

DOI:10.1080/23802359.2018.1473736
PMID:33474254
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7800705/
Abstract

Here, the complete mitogenome of one commercial cultivar in Chinese market which marked 'Shichang' was reported. Circular-mapping mitogenome with an overall A + T content of 64.70% was 37,657 bp in size. It encoded three rRNAs (23s, 16s, and 5s), 25 tRNAs, 38 proteins (including three open reading frames, ORFs). Gene component and arrangement of 'Shichang' mitogenome were identical to those reported cultivars. Further phylogenetic analysis of mitogenomes confirmed that 'Shichang' had closer relationship with cultivar 'Pingbancai', which suggested its parental origin and genetic relationship.

摘要

本文报道了中国市场上一个名为“石场”的商业品种的完整线粒体基因组。该线粒体基因组呈环状,大小为37,657 bp,A+T总含量为64.70%。它编码三种rRNA(23s、16s和5s)、25种tRNA、38种蛋白质(包括三个开放阅读框,ORF)。“石场”线粒体基因组的基因组成和排列与已报道的品种相同。对线粒体基因组的进一步系统发育分析证实,“石场”与“平板菜”品种关系更密切,这表明了其亲本来源和遗传关系。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3eb3/7800705/f80bb3f16270/TMDN_A_1473736_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/3eb3/7800705/f80bb3f16270/TMDN_A_1473736_F0001_B.jpg
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