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濒危苏铁(Cycads Miq. ex Lem.)叶绿体全基因组的特征分析

Characterization of the complete chloroplast genome of endangered Cycads Miq. ex Lem.

作者信息

Lei Jin-Yan, Hinsinger Damien Daniel, Jiang Guo-Feng

机构信息

Plant Ecophysiology & Evolution Group, Guangxi Key Laboratory of Forest Ecology and Conservation, College of Forestry, Guangxi University, Nanning, Guangxi, PR China.

State Key Laboratory for Conservation and Utilization of Subtropical Agro-bioresources, Guangxi University, Nanning, Guangxi, PR China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2018 Oct 26;3(2):1059-1061. doi: 10.1080/23802359.2018.1508387.

DOI:10.1080/23802359.2018.1508387
PMID:33474414
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7800899/
Abstract

The whole chloroplast (cp) genome sequence of has been characterized. The cp genome length was 164,767 bp in length, with a GC content of 39.7%, containing a large single copy (LSC) of 90,226 bp, a small single copy (SSC) of 23,223 bp, and a pair of inverted repeats (IRs) of 25,659 bp. The genome contained 127 genes, including 88 protein-coding genes, 31 tRNA genes, and 8 rRNA genes. A phylogenetic analysis based on complete chloroplast genomes in Cycads indicates that clustered with another ( This complete chloroplast sequence offers a promising tool for further species identification, population genetic conservation, and evolutionary studies of Zamiaceae, as well as for Cycadales.

摘要

已对[物种名称]的完整叶绿体(cp)基因组序列进行了表征。cp基因组长度为164,767 bp,GC含量为39.7%,包含一个90,226 bp的大单拷贝(LSC)、一个23,223 bp的小单拷贝(SSC)和一对25,659 bp的反向重复序列(IRs)。该基因组包含127个基因,包括88个蛋白质编码基因、31个tRNA基因和8个rRNA基因。基于苏铁科完整叶绿体基因组的系统发育分析表明,[物种名称]与另一种[物种名称]聚类在一起(这个完整的叶绿体序列为泽米科以及苏铁目的进一步物种鉴定、种群遗传保护和进化研究提供了一个有前景的工具。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e165/7800899/040e0a31c6d5/TMDN_A_1508387_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/e165/7800899/040e0a31c6d5/TMDN_A_1508387_F0001_B.jpg
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