• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

(杜鹃花科)的完整叶绿体基因组:一种来自中国的特有濒危物种。

The complete chloroplast genome of (Ericaceae): an endemic and endangered species from China.

作者信息

Ma Li-Hui, Zhu Hao-Xiang, Wang Chao-Ying, Li Ming-Yang, Wang Hai-Yang

机构信息

Key Laboratory of Horticulture Science for Southern Mountainous Regions, College of Horticulture and Landscape Architecture, Southwest University, Chongqing, China.

Chongqing City Management College, Chongqing, China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jan 19;6(1):196-197. doi: 10.1080/23802359.2020.1860714.

DOI:10.1080/23802359.2020.1860714
PMID:33537441
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7832514/
Abstract

Diels (Ericaceae) is a Chinese endemic and endangered species with high ornamental value. Here the complete chloroplast (cp) genome of was assembled and characterized. The cp genome is in a total length of 201,047 bp with the typical quadripartite structure of angiosperms, containing two inverted repeats (IRs) of 44,650 bp separated by a large single-copy (LSC) region of 109,134 bp and a small single-copy (SSC) region of 2613 bp. The whole cp genome of contains 143 genes, including 93 protein-coding genes, 42 transfer RNA genes and 8 ribosomal RNA genes. Phylogenetic analysis based on the coding sequences of cp genome within the Ericaceae family suggests that is closely related to .

摘要

吊钟花(杜鹃花科)是中国特有的濒危物种,具有很高的观赏价值。在此,我们对其完整的叶绿体(cp)基因组进行了组装和特征分析。该cp基因组全长201,047 bp,具有被子植物典型的四分体结构,包含两个44,650 bp的反向重复序列(IRs),中间由一个109,134 bp的大单拷贝(LSC)区域和一个2613 bp的小单拷贝(SSC)区域隔开。吊钟花的整个cp基因组包含143个基因,其中包括93个蛋白质编码基因、42个转运RNA基因和8个核糖体RNA基因。基于杜鹃花科cp基因组编码序列的系统发育分析表明,吊钟花与[具体物种]关系密切。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9413/7832514/d8894d903d00/TMDN_A_1860714_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9413/7832514/d8894d903d00/TMDN_A_1860714_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/9413/7832514/d8894d903d00/TMDN_A_1860714_F0001_B.jpg

相似文献

1
The complete chloroplast genome of (Ericaceae): an endemic and endangered species from China.(杜鹃花科)的完整叶绿体基因组:一种来自中国的特有濒危物种。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Jan 19;6(1):196-197. doi: 10.1080/23802359.2020.1860714.
2
The complete chloroplast genome of and its phylogenetic position within Ericaceae.[物种名称]的完整叶绿体基因组及其在杜鹃花科中的系统发育位置。 需注意,你提供的原文中“of and its”部分似乎不完整,缺少具体物种名称。以上译文是基于补充完整物种名称后的推测完整翻译。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Aug 9;6(9):2587-2588. doi: 10.1080/23802359.2021.1959458. eCollection 2021.
3
The complete chloroplast genome of W.P. Fang (Ericaceae), a endemic plant from the Southern Dabie Mountains of China.中国大别山脉南部特有的植物——方氏白珠树(杜鹃花科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Oct 11;7(10):1787-1788. doi: 10.1080/23802359.2022.2127336. eCollection 2022.
4
The complete chloroplast genome of (Ericaceae).(杜鹃花科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 9;5(1):37-38. doi: 10.1080/23802359.2019.1689860.
5
The complete chloroplast genome of (Ericaceae).(杜鹃花科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Oct 30;7(11):1910-1912. doi: 10.1080/23802359.2022.2135403. eCollection 2022.
6
The complete chloroplast genome of (Plantaginaceae): an endemic and Endangered species from China.(车前科)的完整叶绿体基因组:一种来自中国的特有濒危物种。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 9;5(1):51-52. doi: 10.1080/23802359.2019.1694851.
7
The complete chloroplast genome of (Lamiaceae), an endemic species from China.唇形科一种中国特有物种的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jun 24;5(3):2568-2570. doi: 10.1080/23802359.2020.1781562.
8
Phylogenetic relationship and characterization of the complete chloroplast genome of subsp. Maximowicz 1877, an ornamental and medicinal plant in China.中国一种观赏兼药用植物毛百合亚种(Maximowicz 1877)完整叶绿体基因组的系统发育关系及特征分析
Mitochondrial DNA B Resour. 2023 Sep 19;8(9):998-1002. doi: 10.1080/23802359.2023.2259040. eCollection 2023.
9
Long-reads reveal that plastid genome contains extensive repeat sequences, and recombination exists among plastid genomes of photosynthetic Ericaceae.长读长测序显示质体基因组包含大量重复序列,并且在光合杜鹃花科植物的质体基因组之间存在重组。
PeerJ. 2020 Apr 22;8:e9048. doi: 10.7717/peerj.9048. eCollection 2020.
10
The complete chloroplast genome sequence of (Moraceae), an endemic and endangered plant in China.中国特有濒危植物(桑科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Feb 19;6(2):604-605. doi: 10.1080/23802359.2020.1861556.

引用本文的文献

1
High-Quality Genome Assembly and Transcriptome of Provide Insights into Its Evolution and Heat Stress Response.高质量基因组组装与转录组为其进化和热应激反应提供见解。
Plants (Basel). 2025 Apr 17;14(8):1233. doi: 10.3390/plants14081233.
2
The complete chloroplast genome of (ericaceae).(杜鹃花科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2024 Aug 13;9(8):1058-1062. doi: 10.1080/23802359.2024.2391085. eCollection 2024.
3
Recent advancements in the physiological, genetic, and genomic research on s for trait improvement.

本文引用的文献

1
PGA: a software package for rapid, accurate, and flexible batch annotation of plastomes.PGA:一个用于叶绿体基因组快速、准确且灵活批量注释的软件包。
Plant Methods. 2019 May 21;15:50. doi: 10.1186/s13007-019-0435-7. eCollection 2019.
2
RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies.RAxML 版本 8:用于系统发育分析和大型系统发育后分析的工具。
Bioinformatics. 2014 May 1;30(9):1312-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btu033. Epub 2014 Jan 21.
3
MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability.
近期在用于性状改良的[具体研究对象]的生理学、遗传学和基因组学研究方面取得的进展。 你提供的原文中“s”指代不明,以上是补充完整指代后的译文,你可根据实际情况调整。
3 Biotech. 2024 Jun;14(6):164. doi: 10.1007/s13205-024-04006-6. Epub 2024 May 26.
4
The complete chloroplast genome of (Ericaceae).(杜鹃花科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Oct 30;7(11):1910-1912. doi: 10.1080/23802359.2022.2135403. eCollection 2022.
5
The complete chloroplast genome of W.P. Fang (Ericaceae), a endemic plant from the Southern Dabie Mountains of China.中国大别山脉南部特有的植物——方氏白珠树(杜鹃花科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2022 Oct 11;7(10):1787-1788. doi: 10.1080/23802359.2022.2127336. eCollection 2022.
6
The complete chloroplast genome of (Ericaceae).(杜鹃花科)的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 May 24;6(6):1749-1751. doi: 10.1080/23802359.2021.1931504.
MAFFT 多序列比对软件版本 7:性能和易用性的改进。
Mol Biol Evol. 2013 Apr;30(4):772-80. doi: 10.1093/molbev/mst010. Epub 2013 Jan 16.
4
SPAdes: a new genome assembly algorithm and its applications to single-cell sequencing.SPAdes:一种新的基因组组装算法及其在单细胞测序中的应用
J Comput Biol. 2012 May;19(5):455-77. doi: 10.1089/cmb.2012.0021. Epub 2012 Apr 16.
5
MrBayes 3.2: efficient Bayesian phylogenetic inference and model choice across a large model space.MrBayes 3.2:在大型模型空间中进行高效的贝叶斯系统发育推断和模型选择。
Syst Biol. 2012 May;61(3):539-42. doi: 10.1093/sysbio/sys029. Epub 2012 Feb 22.