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壳斗科锥属植物的完整叶绿体基因组。 (注:原文中“Mill.”指代不明,可能是某个特定的锥属植物种加词之类的,这里按一般情况翻译为“锥属植物”)

The complete chloroplast genome of Mill. (Fagaceae).

作者信息

Zhu Cancan, Zhang Shijie, Bai Xiaoqian, Guan Fuqin, Chen Yu, Zhao Yuqiang, Li Mimi

机构信息

Institute of Botany, Jiangsu Province and Chinese Academy of Sciences, Nanjing, PR China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 28;6(3):1249-1250. doi: 10.1080/23802359.2021.1903359.

DOI:10.1080/23802359.2021.1903359
PMID:33829098
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8009113/
Abstract

Mill. is mainly grown in the temperate regions of continental Europe, and it has a considerable economic value. In this study, the complete chloroplast genome sequence of was characterized. Leaves were collected from the National Botanical Garden of Latvia. The chloroplast genome was determined to be 160,938 bp in length. It contained large single-copy (LSC) and small single-copy (SSC) regions of 90,519 and 18,967 bp, respectively, which were separated by a pair of 25,726 bp inverted repeat (IR) regions. The genome is predicted to contain 130 genes, including 83 protein-coding genes, 37 genes, eight genes, and two pseudo genes. The overall GC content of the genome is 36.8%. A phylogenetic tree reconstructed by 34 chloroplast genomes reveals that is most closely related to the clade including , and .

摘要

Mill.主要生长在欧洲大陆的温带地区,具有相当大的经济价值。在本研究中,对其叶绿体全基因组序列进行了表征。叶片采自拉脱维亚国家植物园。叶绿体基因组长度测定为160,938 bp。它包含分别为90,519和18,967 bp的大单拷贝(LSC)和小单拷贝(SSC)区域,这两个区域被一对25,726 bp的反向重复(IR)区域隔开。该基因组预计包含130个基因,包括83个蛋白质编码基因、37个基因、8个基因和2个假基因。基因组的总体GC含量为36.8%。由34个叶绿体基因组重建的系统发育树表明,Mill.与包括、和的分支关系最为密切。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d34f/8009113/e72d8bc62c0f/TMDN_A_1903359_F0001_B.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/d34f/8009113/e72d8bc62c0f/TMDN_A_1903359_F0001_B.jpg
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