• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

一个栽培品种的完整叶绿体基因组序列。

The complete chloroplast genome sequence of a cultivar.

作者信息

Li Ying-Lin, Gu Guang-Shi, Wu Jun-Jian, Liu Bin, Ye Shu-Tao, Chen Hui, Chen Shi-Pin, Li Yu

机构信息

College of Forestry, Fujian Agriculture and Forestry University, Fuzhou, PR China.

出版信息

Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 17;5(1):180-181. doi: 10.1080/23802359.2019.1698376.

DOI:10.1080/23802359.2019.1698376
PMID:33366476
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC7748877/
Abstract

(Skam)Rehd. et Wils is an important woody plant producing nuts in China. In this study, the complete chloroplast genome sequence of was reported by using the Illumina Hiseq 2500 platform. The complete chloroplast sequence is 160,807 bp, including large single-copy (LSC) region of 90,394 bp, small single-copy (SSC) region of 18,963 bp, and a pair of invert repeats (IR) regions of 25,725 bp. Plastid genome contains 112 genes, 78 protein-coding genes, 30 tRNA genes, and 4 rRNA genes. Based on 26 chloroplast genomes, phylogenetic analysis indicates that is closely related to in Fagaceae.

摘要

(水青冈属)锐齿水青冈是中国一种重要的产坚果木本植物。在本研究中,利用Illumina Hiseq 2500平台报道了其完整叶绿体基因组序列。完整叶绿体序列为160,807 bp,包括一个90,394 bp的大单拷贝(LSC)区域、一个18,963 bp的小单拷贝(SSC)区域以及一对25,725 bp的反向重复(IR)区域。质体基因组包含112个基因,78个蛋白质编码基因、30个tRNA基因和4个rRNA基因。基于26个叶绿体基因组的系统发育分析表明,锐齿水青冈与壳斗科的[此处原文缺失相关物种名]关系密切。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/da7f/7748877/9a84fe2b421a/TMDN_A_1698376_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/da7f/7748877/9a84fe2b421a/TMDN_A_1698376_F0001_C.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/da7f/7748877/9a84fe2b421a/TMDN_A_1698376_F0001_C.jpg

相似文献

1
The complete chloroplast genome sequence of a cultivar.一个栽培品种的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Dec 17;5(1):180-181. doi: 10.1080/23802359.2019.1698376.
2
The complete chloroplast genome of 'Chuizhili'.“垂枝梨”的完整叶绿体基因组
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 26;6(3):1160-1161. doi: 10.1080/23802359.2021.1903360.
3
The complete chloroplast genome of Mill. (Fagaceae).壳斗科锥属植物的完整叶绿体基因组。 (注:原文中“Mill.”指代不明,可能是某个特定的锥属植物种加词之类的,这里按一般情况翻译为“锥属植物”)
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 28;6(3):1249-1250. doi: 10.1080/23802359.2021.1903359.
4
The complete chloroplast genome sequence of (Fagaceae).壳斗科(山毛榉科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Jul 12;4(2):2493-2494. doi: 10.1080/23802359.2019.1637299.
5
The complete chloroplast genome of (Ranunculaceae).毛茛科(Ranunculaceae)植物的完整叶绿体基因组。
Mitochondrial DNA B Resour. 2021 Mar 31;6(4):1319-1320. doi: 10.1080/23802359.2021.1907807.
6
Complete chloroplast genome sequence of (Bambusodae).(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Feb 6;5(1):306-307. doi: 10.1080/23802359.2019.1702484.
7
The complete chloroplast genome sequence of (Cabombaceae).(莼菜科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Nov 6;4(2):3842-3843. doi: 10.1080/23802359.2019.1674734.
8
The complete chloroplast genome sequence of (Staphyleaceae).省沽油科(省沽油科)的完整叶绿体基因组序列。 (你提供的原文似乎不完整,“The complete chloroplast genome sequence of ”后面应该还有具体物种名称等信息)
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Oct 11;4(2):3484-3485. doi: 10.1080/23802359.2019.1674735.
9
Complete chloroplast genome sequence of (Bambuseae).(竹亚科)的完整叶绿体基因组序列
Mitochondrial DNA B Resour. 2020 Jul 23;5(3):2972-2973. doi: 10.1080/23802359.2020.1793699.
10
The complete chloroplast genome sequence of (Rhizophoraceae).(红树科)的完整叶绿体基因组序列。
Mitochondrial DNA B Resour. 2019 Oct 11;4(2):3494-3495. doi: 10.1080/23802359.2019.1674745.

本文引用的文献

1
Bandage: interactive visualization of de novo genome assemblies.绷带:从头基因组组装的交互式可视化
Bioinformatics. 2015 Oct 15;31(20):3350-2. doi: 10.1093/bioinformatics/btv383. Epub 2015 Jun 22.
2
RAxML version 8: a tool for phylogenetic analysis and post-analysis of large phylogenies.RAxML 版本 8:用于系统发育分析和大型系统发育后分析的工具。
Bioinformatics. 2014 May 1;30(9):1312-3. doi: 10.1093/bioinformatics/btu033. Epub 2014 Jan 21.
3
OrganellarGenomeDRAW--a suite of tools for generating physical maps of plastid and mitochondrial genomes and visualizing expression data sets.
细胞器基因组绘图软件--一套用于生成质体和线粒体基因组物理图谱以及可视化表达数据集的工具。
Nucleic Acids Res. 2013 Jul;41(Web Server issue):W575-81. doi: 10.1093/nar/gkt289. Epub 2013 Apr 22.
4
MAFFT multiple sequence alignment software version 7: improvements in performance and usability.MAFFT 多序列比对软件版本 7:性能和易用性的改进。
Mol Biol Evol. 2013 Apr;30(4):772-80. doi: 10.1093/molbev/mst010. Epub 2013 Jan 16.
5
Geneious Basic: an integrated and extendable desktop software platform for the organization and analysis of sequence data.Geneious Basic:一个集成和可扩展的桌面软件平台,用于组织和分析序列数据。
Bioinformatics. 2012 Jun 15;28(12):1647-9. doi: 10.1093/bioinformatics/bts199. Epub 2012 Apr 27.