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欧洲质谱生物信息学共同体(EuBIC-MS):一个用于生物信息学培训与研究的开放共同体。

The European Bioinformatics Community for Mass Spectrometry (EuBIC-MS): an open community for bioinformatics training and research.

作者信息

Bittremieux Wout, Bouyssié David, Dorfer Viktoria, Locard-Paulet Marie, Perez-Riverol Yasset, Schwämmle Veit, Uszkoreit Julian, Van Den Bossche Tim

机构信息

European Bioinformatics Community for Mass Spectrometry, Belgium.

University of California San Diego, La Jolla, CA, USA.

出版信息

Rapid Commun Mass Spectrom. 2025 May;39 Suppl 1:e9087. doi: 10.1002/rcm.9087. Epub 2021 Apr 16.

DOI:10.1002/rcm.9087
PMID:33861485
Abstract

The European Bioinformatics Community for Mass Spectrometry (EuBIC-MS; eubic-ms.org) was founded in 2014 to unite European computational mass spectrometry researchers and proteomics bioinformaticians working in academia and industry. EuBIC-MS maintains educational resources (proteomics-academy.org) and organises workshops at national and international conferences on proteomics and mass spectrometry. Furthermore, EuBIC-MS is actively involved in several community initiatives such as the Human Proteome Organization's Proteomics Standards Initiative (HUPO-PSI). Apart from these collaborations, EuBIC-MS has organised two Winter Schools and two Developers' Meetings that have contributed to the strengthening of the European mass spectrometry network and fostered international collaboration in this field, even beyond Europe. Moreover, EuBIC-MS is currently actively developing a community-driven standard dedicated to mass spectrometry data annotation (SDRF-Proteomics) that will facilitate data reuse and collaboration. This manuscript highlights what EuBIC-MS is, what it does, and what it already has achieved. A warm invitation is extended to new researchers at all career stages to join the EuBIC-MS community on its Slack channel (eubic.slack.com).

摘要

欧洲质谱生物信息学社区(EuBIC-MS;eubic-ms.org)成立于2014年,旨在团结欧洲从事学术和工业领域的计算质谱研究人员以及蛋白质组学生物信息学家。EuBIC-MS维护教育资源(proteomics-academy.org),并在国内和国际蛋白质组学与质谱会议上组织研讨会。此外,EuBIC-MS积极参与多项社区倡议,如人类蛋白质组组织的蛋白质组学标准倡议(HUPO-PSI)。除了这些合作之外,EuBIC-MS还组织了两次冬季学校和两次开发者会议,这些活动有助于加强欧洲质谱网络,并促进了该领域的国际合作,甚至超越了欧洲范围。此外,EuBIC-MS目前正在积极开发一项由社区驱动的、专门用于质谱数据注释的标准(SDRF-蛋白质组学),这将有助于数据的重复使用和合作。本文阐述了EuBIC-MS是什么、做什么以及已经取得了哪些成就。在此热烈邀请处于各个职业阶段的新研究人员通过其Slack频道(eubic.slack.com)加入EuBIC-MS社区。

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