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一种高通量基于放射性的 SARS-CoV-2 nsp10-nsp16 复合物筛选方法。

A High-Throughput Radioactivity-Based Assay for Screening SARS-CoV-2 nsp10-nsp16 Complex.

机构信息

Structural Genomics Consortium, University of Toronto, Toronto, Ontario, Canada.

Department of Pharmacology and Toxicology, University of Toronto, Toronto, Ontario, Canada.

出版信息

SLAS Discov. 2021 Jul;26(6):757-765. doi: 10.1177/24725552211008863. Epub 2021 Apr 19.

DOI:10.1177/24725552211008863
PMID:33874769
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8216315/
Abstract

Frequent outbreaks of novel coronaviruses (CoVs), highlighted by the current severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) pandemic, necessitate the development of therapeutics that could be easily and effectively administered worldwide. The conserved mRNA-capping process enables CoVs to evade their host immune system and is a target for antiviral development. Nonstructural protein (nsp) 16 in complex with nsp10 catalyzes the final step of coronaviral mRNA capping through its 2'--methylation activity. Like other methyltransferases, the SARS-CoV-2 nsp10-nsp16 complex is druggable. However, the availability of an optimized assay for high-throughput screening (HTS) is an unmet need. Here, we report the development of a radioactivity-based assay for the methyltransferase activity of the nsp10-nsp16 complex in a 384-well format, kinetic characterization, and optimization of the assay for HTS (Z' factor = 0.83). Considering the high conservation of nsp16 across known CoV species, the potential inhibitors targeting the SARS-CoV-2 nsp10-nsp16 complex may also be effective against other emerging pathogenic CoVs.

摘要

新型冠状病毒(CoV)频繁爆发,当前严重急性呼吸综合征冠状病毒 2(SARS-CoV-2)大流行尤为突出,这就需要开发出能够在全球范围内轻松有效使用的治疗方法。保守的 mRNA 加帽过程使 CoV 能够逃避其宿主免疫系统,成为抗病毒药物开发的靶点。非结构蛋白(nsp)16 与 nsp10 形成复合物,通过其 2'-甲基化活性催化冠状病毒 mRNA 加帽的最后一步。与其他甲基转移酶一样,SARS-CoV-2 nsp10-nsp16 复合物是可成药的。然而,高通量筛选(HTS)的优化测定法仍然难以实现。在这里,我们报告了在 384 孔板格式中用于 nsp10-nsp16 复合物甲基转移酶活性的基于放射性的测定法的开发、动力学特征以及 HTS 测定法的优化(Z' 因子=0.83)。考虑到 nsp16 在已知的 CoV 物种中高度保守,针对 SARS-CoV-2 nsp10-nsp16 复合物的潜在抑制剂也可能对其他新兴的致病性 CoV 有效。

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