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用于 HIV-1 病毒组装阻断的自组装 RNA 纳米结构的合理设计。

Rational design of self-assembled RNA nanostructures for HIV-1 virus assembly blockade.

机构信息

Department of Biomedical Engineering, College of Future Technology, Peking University, Beijing 100871, China.

Department of Biomedical Engineering, College of Engineering, Peking University, Beijing 100871, China.

出版信息

Nucleic Acids Res. 2022 May 6;50(8):e44. doi: 10.1093/nar/gkab1282.

DOI:10.1093/nar/gkab1282
PMID:34967412
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9071489/
Abstract

Many pathological processes are driven by RNA-protein interactions, making such interactions promising targets for molecular interventions. HIV-1 assembly is one such process, in which the viral genomic RNA interacts with the viral Gag protein and serves as a scaffold to drive Gag multimerization that ultimately leads to formation of a virus particle. Here, we develop self-assembled RNA nanostructures that can inhibit HIV-1 virus assembly, achieved through hybridization of multiple artificial small RNAs with a stem-loop structure (STL) that we identify as a prominent ligand of Gag that can inhibit virus particle production via STL-Gag interactions. The resulting STL-decorated nanostructures (double and triple stem-loop structures denoted as Dumbbell and Tribell, respectively) can elicit more pronounced viral blockade than their building blocks, with the inhibition arising as a result of nanostructures interfering with Gag multimerization. These findings could open up new avenues for RNA-based therapy.

摘要

许多病理过程是由 RNA-蛋白质相互作用驱动的,这使得这些相互作用成为分子干预的有前途的靶点。HIV-1 组装就是这样一个过程,其中病毒基因组 RNA 与病毒 Gag 蛋白相互作用,并作为支架驱动 Gag 多聚化,最终导致病毒颗粒的形成。在这里,我们开发了可以抑制 HIV-1 病毒组装的自组装 RNA 纳米结构,这是通过与我们确定的具有茎环结构(STL)的多个人工小 RNA 杂交来实现的,该 STL 是 Gag 的一个主要配体,可以通过 STL-Gag 相互作用抑制病毒颗粒的产生。由此产生的 STL 修饰的纳米结构(分别表示为哑铃和三链结构的双链和三链结构)可以比其构建块更显著地引发病毒阻断,抑制作用是由于纳米结构干扰 Gag 多聚化而产生的。这些发现可能为基于 RNA 的治疗开辟新途径。

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