• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

基于机器学习的密度泛函理论核磁共振计算在高通量计算机辅助药物设计中的应用:用于复杂生物碱的溶液结构验证和修正。

DU8ML: Machine Learning-Augmented Density Functional Theory Nuclear Magnetic Resonance Computations for High-Throughput In Silico Solution Structure Validation and Revision of Complex Alkaloids.

机构信息

Department of Chemistry and Biochemistry, University of Denver, Denver, Colorado 80208, United States.

出版信息

J Org Chem. 2022 Apr 1;87(7):4818-4828. doi: 10.1021/acs.joc.2c00169. Epub 2022 Mar 18.

DOI:10.1021/acs.joc.2c00169
PMID:35302771
Abstract

Machine learning (ML) profoundly improves the accuracy of the fast DU8+ hybrid density functional theory/parametric computations of nuclear magnetic resonance spectra, allowing for high throughput in silico validation and revision of complex alkaloids and other natural products. Of nearly 170 alkaloids surveyed, 35 structures are revised with the next-generation ML-augmented DU8 method, termed DU8ML.

摘要

机器学习 (ML) 极大地提高了快速 DU8+ 杂化密度泛函理论/参数计算核磁共振谱的准确性,使得复杂生物碱和其他天然产物的高通量计算机模拟验证和修正成为可能。在近 170 种调查的生物碱中,有 35 种结构使用新一代 ML 增强的 DU8 方法进行了修正,称为 DU8ML。

相似文献

1
DU8ML: Machine Learning-Augmented Density Functional Theory Nuclear Magnetic Resonance Computations for High-Throughput In Silico Solution Structure Validation and Revision of Complex Alkaloids.基于机器学习的密度泛函理论核磁共振计算在高通量计算机辅助药物设计中的应用:用于复杂生物碱的溶液结构验证和修正。
J Org Chem. 2022 Apr 1;87(7):4818-4828. doi: 10.1021/acs.joc.2c00169. Epub 2022 Mar 18.
2
Peculiar Reaction Products and Mechanisms Revisited with Machine Learning-Augmented Computational NMR.机器学习增强计算 NMR 重新探讨特殊反应产物和机制
J Org Chem. 2022 Jul 1;87(13):8589-8598. doi: 10.1021/acs.joc.2c00749. Epub 2022 Jun 18.
3
Brief overview of recently reported misassigned natural products and their revisions enabled by DU8ML, a machine learning-augmented DFT computational NMR method.简要概述了最近报道的错误归属天然产物及其通过 DU8ML(一种机器学习增强的 DFT 计算 NMR 方法)进行的修订。
Nat Prod Rep. 2022 Nov 16;39(11):2003-2007. doi: 10.1039/d2np00051b.
4
Stereochemical revision of xylogranatin F by GIAO and DU8+ NMR calculations.通过 GIAO 和 DU8+NMR 计算对木兰花碱 F 的立体化学进行修订。
Chirality. 2020 May;32(5):515-523. doi: 10.1002/chir.23189. Epub 2020 Mar 3.
5
High-Throughput in Silico Structure Validation and Revision of Halogenated Natural Products Is Enabled by Parametric Corrections to DFT-Computed C NMR Chemical Shifts and Spin-Spin Coupling Constants.基于参数修正的 DFT 计算 13C NMR 化学位移和自旋-自旋偶合常数实现了卤代天然产物的高通量计算结构验证和修正。
J Org Chem. 2017 Apr 7;82(7):3368-3381. doi: 10.1021/acs.joc.7b00188. Epub 2017 Mar 24.
6
Natural Products Containing the Oxetane and Related Moieties Present Additional Challenges for Structure Elucidation: A DU8+ Computational Case Study.天然产物中含有的环氧乙烷和相关部分对结构解析提出了额外的挑战:一个 DU8+ 的计算案例研究。
J Org Chem. 2019 Jun 21;84(12):7575-7586. doi: 10.1021/acs.joc.9b01005. Epub 2019 Jun 7.
7
DU8+ Computations Reveal a Common Challenge in the Structure Assignment of Natural Products Containing a Carboxylic Anhydride Moiety.DU8+计算揭示了含有羧酸酐部分的天然产物结构归属中的一个常见挑战。
J Org Chem. 2021 Dec 3;86(23):17511-17515. doi: 10.1021/acs.joc.1c02291. Epub 2021 Nov 8.
8
Addressing the Challenges of Structure Elucidation in Natural Products Possessing the Oxirane Moiety.解决具有环氧部分的天然产物结构阐明的挑战。
J Org Chem. 2018 Aug 3;83(15):8341-8352. doi: 10.1021/acs.joc.8b01027. Epub 2018 Jul 10.
9
Computationally Assisted Structural Revision of Flavoalkaloids with a Seven-Membered Ring: Aquiledine, Isoaquiledine, and Cheliensisine.运用计算方法对含七元环的黄烷酮生物碱进行结构修饰:水黄皮碱、异水黄皮碱和垂序水黄皮碱。
J Nat Prod. 2020 Nov 25;83(11):3347-3353. doi: 10.1021/acs.jnatprod.0c00691. Epub 2020 Oct 21.
10
Heteronuclear NMR studies of the chromone alkaloids and revision of the structure of some piperidino-chromone alkaloids.色酮生物碱的异核核磁共振研究及一些哌啶基色酮生物碱结构的修正
Planta Med. 1995 Apr;61(2):154-7. doi: 10.1055/s-2006-958037.

引用本文的文献

1
Concise Synthesis of Cyctetryptomycin A and B Enabled by Zr-Catalyzed Dimerization.锆催化二聚作用实现细胞色霉素A和B的简洁合成
Angew Chem Int Ed Engl. 2025 Jan 10;64(2):e202414295. doi: 10.1002/anie.202414295. Epub 2024 Nov 6.
2
Bent naphthodithiophenes: synthesis and characterization of isomeric fluorophores.弯曲萘并二噻吩:异构荧光团的合成与表征
RSC Adv. 2024 Aug 12;14(35):25120-25129. doi: 10.1039/d4ra04850d.
3
Kallopterolides A-I, a New Subclass of -Diterpenes Isolated from the Southwestern Caribbean Sea Plume .
Kallopterolides A-I,一种从西南加勒比海羽流中分离得到的新型 -二萜类化合物。
Molecules. 2024 May 24;29(11):2493. doi: 10.3390/molecules29112493.
4
Complexity-Building ESIPT-Assisted Synthesis of Fused Polyheterocyclic Sulfonamides.基于激发态分子内质子转移(ESIPT)辅助的稠合多杂环磺酰胺的复杂性构建合成
Molecules. 2023 Sep 10;28(18):6549. doi: 10.3390/molecules28186549.
5
Bromination of 7-norbornene derivatives revisited: failure of a computational NMR method in elucidating the configuration of an organic structure.7-降冰片烯衍生物的溴化反应再探讨:一种计算核磁共振方法在阐明有机结构构型方面的失败
Beilstein J Org Chem. 2023 Jun 2;19:764-770. doi: 10.3762/bjoc.19.56. eCollection 2023.
6
Genomics-Guided Efficient Identification of 2,5-Diketopiperazine Derivatives from Actinobacteria.基于基因组学的方法高效鉴定放线菌来源的 2,5-二酮哌嗪衍生物。
Chembiochem. 2023 Feb 1;24(3):e202200502. doi: 10.1002/cbic.202200502. Epub 2022 Oct 5.
7
Collective total synthesis of C4-oxygenated securinine-type alkaloids via stereocontrolled diversifications on the piperidine core.通过对哌啶核心的立体控制多样化实现 C4-氧代 securinine 型生物碱的集体全合成。
Nat Commun. 2022 Sep 2;13(1):5149. doi: 10.1038/s41467-022-32902-z.