First detection of SARS-CoV-2 Omicron BA.4 variant in Western Pennsylvania, United States.
作者信息
Phan Tung, Boes Stephanie, McCullough Melissa, Gribschaw Jamie, Marsh Jane W, Harrison Lee H, Wells Alan
机构信息
Department of Pathology, University of Pittsburgh, Pittsburgh, Pennsylvania, USA.
Clinical Microbiology Laboratory, UPMC Hospital System, Pittsburgh, Pennsylvania, USA.
出版信息
J Med Virol. 2022 Sep;94(9):4053-4055. doi: 10.1002/jmv.27846. Epub 2022 May 16.
Abstract
摘要
相似文献
1
First detection of SARS-CoV-2 Omicron BA.4 variant in Western Pennsylvania, United States.在美国宾夕法尼亚州西部首次检测到新冠病毒奥密克戎BA.4变种。
J Med Virol. 2022 Sep;94(9):4053-4055. doi: 10.1002/jmv.27846. Epub 2022 May 16.
2
Emergence of SARS-CoV-2 Omicron BA.5 variant of concern in Western Pennsylvania, United States.严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）奥密克戎BA.5变异株在美国宾夕法尼亚州西部出现，成为令人担忧的变种。
J Med Virol. 2022 Oct;94(10):4593-4594. doi: 10.1002/jmv.27945. Epub 2022 Jun 23.
3
Infection with SARS-CoV-2 Omicron Variant 24 Days after Non-Omicron Infection, Pennsylvania, USA.美国宾夕法尼亚州，非奥密克戎感染 24 天后感染 SARS-CoV-2 奥密克戎变异株 2 型。
Emerg Infect Dis. 2022 Sep;28(9):1911-1913. doi: 10.3201/eid2809.220539. Epub 2022 Aug 1.
4
Introduction and Rapid Spread of SARS-CoV-2 Omicron Variant and Dynamics of BA.1 and BA.1.1 Sublineages, Finland, December 2021.引言：2021 年 12 月，芬兰出现 SARS-CoV-2 奥密克戎变异株的引入和快速传播，以及 BA.1 和 BA.1.1 亚谱系的动态变化
Emerg Infect Dis. 2022 Jun;28(6):1229-1232. doi: 10.3201/eid2806.220515. Epub 2022 Apr 4.
5
Genomic Surveillance for SARS-CoV-2 Variants: Predominance of the Delta (B.1.617.2) and Omicron (B.1.1.529) Variants - United States, June 2021-January 2022.SARS-CoV-2 变体的基因组监测：Delta（B.1.617.2）和奥密克戎（B.1.1.529）变体占主导地位-美国，2021 年 6 月-2022 年 1 月。
MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2022 Feb 11;71(6):206-211. doi: 10.15585/mmwr.mm7106a4.
6
SARS-CoV-2 B.1.1.529 (Omicron) Variant - United States, December 1-8, 2021.SARS-CoV-2 B.1.1.529（奥密克戎）变异株-美国，2021 年 12 月 1 日-8 日。
MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2021 Dec 17;70(50):1731-1734. doi: 10.15585/mmwr.mm7050e1.
7
Admissions to a large tertiary care hospital and Omicron BA.1 and BA.2 SARS-CoV-2 polymerase chain reaction positivity: primary, contributing, or incidental COVID-19.大型三级保健医院入院与奥密克戎 BA.1 和 BA.2 SARS-CoV-2 聚合酶链反应阳性：原发性、促成性还是偶发性 COVID-19。
Int J Infect Dis. 2022 Sep;122:665-668. doi: 10.1016/j.ijid.2022.07.030. Epub 2022 Jul 13.
8
Trends in Disease Severity and Health Care Utilization During the Early Omicron Variant Period Compared with Previous SARS-CoV-2 High Transmission Periods - United States, December 2020-January 2022.疾病严重程度和医疗保健利用趋势在奥密克戎变异株早期与之前 SARS-CoV-2 高传播期相比-美国，2020 年 12 月至 2022 年 1 月。
MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2022 Jan 28;71(4):146-152. doi: 10.15585/mmwr.mm7104e4.
9
10
Effectiveness of 2, 3, and 4 COVID-19 mRNA Vaccine Doses Among Immunocompetent Adults During Periods when SARS-CoV-2 Omicron BA.1 and BA.2/BA.2.12.1 Sublineages Predominated - VISION Network, 10 States, December 2021-June 2022.2、3 和 4 剂 COVID-19 mRNA 疫苗在 SARS-CoV-2 奥密克戎 BA.1 和 BA.2/BA.2.12.1 亚谱系占主导地位期间对免疫功能正常成年人的有效性 - VISION 网络，10 个州，2021 年 12 月至 2022 年 6 月。
MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2022 Jul 22;71(29):931-939. doi: 10.15585/mmwr.mm7129e1.
引用本文的文献
1
Nationwide seroprevalence of SARS-CoV-2 Delta variant and five Omicron sublineages in companion cats and dogs in the USA: insights into their role in COVID-19 epidemiology.美国伴侣猫和狗中SARS-CoV-2 Delta变异株及五种奥密克戎亚谱系的全国血清流行率：深入了解它们在COVID-19流行病学中的作用。
Emerg Microbes Infect. 2025 Dec;14(1):2437246. doi: 10.1080/22221751.2024.2437246. Epub 2024 Dec 11.
2
An ARMS-Multiplex PCR Targeting SARS-CoV-2 Omicron Sub-Variants.一种靶向严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）奥密克戎亚变体的扩增不应变突变系统多重聚合酶链反应（ARMS-Multiplex PCR）
Pathogens. 2023 Aug 6;12(8):1017. doi: 10.3390/pathogens12081017.
3
Structural Basis for the Enhanced Infectivity and Immune Evasion of Omicron Subvariants.结构基础：奥密克戎亚变体增强的传染性和免疫逃避能力。
Viruses. 2023 Jun 20;15(6):1398. doi: 10.3390/v15061398.
4
The relative prevalence of the Omicron variant within SARS-CoV-2 infected cohorts in different countries: A systematic review.不同国家 SARS-CoV-2 感染人群中奥密克戎变异株的相对流行率：系统评价。
Hum Vaccin Immunother. 2023 Dec 31;19(1):2212568. doi: 10.1080/21645515.2023.2212568.
5
Evolution of SARS-CoV-2 Variants: Implications on Immune Escape, Vaccination, Therapeutic and Diagnostic Strategies.SARS-CoV-2 变异株的进化：对免疫逃逸、疫苗接种、治疗和诊断策略的影响。
Viruses. 2023 Apr 10;15(4):944. doi: 10.3390/v15040944.
6
Genomic surveillance of SARS-CoV-2 in COVID-19 vaccinated healthcare workers in Lebanon.黎巴嫩 COVID-19 疫苗接种医护人员中 SARS-CoV-2 的基因组监测。
BMC Med Genomics. 2023 Jan 27;16(1):14. doi: 10.1186/s12920-023-01443-9.
7
SARS-CoV-2 variants: Impact on biological and clinical outcome.严重急性呼吸综合征冠状病毒2变体：对生物学和临床结果的影响。
Front Med (Lausanne). 2022 Nov 10;9:995960. doi: 10.3389/fmed.2022.995960. eCollection 2022.
8
Recent developments in the immunopathology of COVID-19.COVID-19 免疫病理学的最新进展。
Allergy. 2023 Feb;78(2):369-388. doi: 10.1111/all.15593. Epub 2022 Dec 5.
9
Structures of ACE2-SIT1 recognized by Omicron variants of SARS-CoV-2.被新冠病毒奥密克戎变体识别的ACE2-SIT1结构
Cell Discov. 2022 Nov 16;8(1):123. doi: 10.1038/s41421-022-00488-x.
10
Mini-evaluation of the Lyra SARS-CoV-2 assay to detect Omicron BA.1 and BA.2 in nasopharyngeal swabs.用于检测鼻咽拭子中奥密克戎BA.1和BA.2的Lyra SARS-CoV-2检测方法的小型评估。
J Clin Virol Plus. 2022 Nov;2(4):100118. doi: 10.1016/j.jcvp.2022.100118. Epub 2022 Oct 18.
本文引用的文献
1
Identification of SARS-CoV-2 variants using viral sequencing for the Centers for Disease Control and Prevention genomic surveillance program.使用病毒测序对疾病预防控制中心基因组监测计划进行 SARS-CoV-2 变异体的鉴定。
BMC Infect Dis. 2022 Apr 25;22(1):404. doi: 10.1186/s12879-022-07374-7.
2
Development of a One-Step Qualitative RT-PCR Assay to Detect the SARS-CoV-2 Omicron (B.1.1.529) Variant in Respiratory Specimens.开发一种一步法定量逆转录聚合酶链反应检测法以检测呼吸道标本中的严重急性呼吸综合征冠状病毒2奥密克戎（B.1.1.529）变体
J Clin Microbiol. 2022 Mar 16;60(3):e0002422. doi: 10.1128/jcm.00024-22. Epub 2022 Feb 2.
3
Neutralizing antibodies against the SARS-CoV-2 Omicron variant BA.1 following homologous and heterologous CoronaVac or BNT162b2 vaccination.接种同源或异源科兴疫苗或辉瑞疫苗后针对奥密克戎变异株 BA.1 的中和抗体。
Nat Med. 2022 Mar;28(3):486-489. doi: 10.1038/s41591-022-01704-7. Epub 2022 Jan 20.
4
SARS-CoV-2 Omicron Mutation Is Faster than the Chase: Multiple Mutations on Spike/ACE2 Interaction Residues.严重急性呼吸综合征冠状病毒2型奥密克戎变异株的突变速度比追踪速度还快：刺突蛋白/血管紧张素转换酶2相互作用残基上的多个突变
Immune Netw. 2021 Dec 23;21(6):e38. doi: 10.4110/in.2021.21.e38. eCollection 2021 Dec.
5
Omicron variant of SARS-CoV-2: Genomics, transmissibility, and responses to current COVID-19 vaccines.SARS-CoV-2 的奥密克戎变异株：基因组学、传染性，以及对当前 COVID-19 疫苗的反应。
J Med Virol. 2022 May;94(5):1825-1832. doi: 10.1002/jmv.27588. Epub 2022 Jan 23.
6
OMICRON (B.1.1.529): A new SARS-CoV-2 variant of concern mounting worldwide fear.奥密克戎（B.1.1.529）：一种引起全球恐慌的新型关注变异株。
J Med Virol. 2022 May;94(5):1821-1824. doi: 10.1002/jmv.27541. Epub 2021 Dec 30.
7
SARS-CoV-2 nucleocapsid protein binds host mRNAs and attenuates stress granules to impair host stress response.严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）核衣壳蛋白与宿主信使核糖核酸（mRNAs）结合并减弱应激颗粒，从而损害宿主应激反应。
iScience. 2022 Jan 21;25(1):103562. doi: 10.1016/j.isci.2021.103562. Epub 2021 Dec 4.
8
Omicron emerges.奥密克戎出现了。
New Sci. 2021 Dec 4;252(3363):7. doi: 10.1016/S0262-4079(21)02140-0. Epub 2021 Dec 3.
9
Omicron variant (B.1.1.529) of SARS-CoV-2, a global urgent public health alert!严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）的奥密克戎变异株（B.1.1.529），全球紧急公共卫生警报！
J Med Virol. 2022 Apr;94(4):1255-1256. doi: 10.1002/jmv.27491. Epub 2021 Dec 7.
10
The next phase of SARS-CoV-2 surveillance: real-time molecular epidemiology.严重急性呼吸综合征冠状病毒2（SARS-CoV-2）监测的下一阶段：实时分子流行病学
Nat Med. 2021 Sep;27(9):1518-1524. doi: 10.1038/s41591-021-01472-w. Epub 2021 Sep 9.
Zotero 插件