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臭氧氧化鸟嘌呤在 DNA 中生成的主要产物的鉴定。

Identification of the Major Product of Guanine Oxidation in DNA by Ozone.

机构信息

Department of Chemistry, University of Utah, 315 S. 1400 E., Salt Lake City, Utah 84112-0850, United States.

出版信息

Chem Res Toxicol. 2022 Oct 17;35(10):1809-1813. doi: 10.1021/acs.chemrestox.2c00103. Epub 2022 Jun 1.

DOI:10.1021/acs.chemrestox.2c00103
PMID:35642826
Abstract

Ozonolysis of guanosine formed the 5-carboxamido-5-formamido-2-iminohydantoin (2Ih) nucleoside along with trace spiroiminodihydantoin (Sp). On the basis of literature precedent, we propose an unconventional ozone mechanism involving incorporation of only one oxygen atom of O to form 2Ih with evolution of singlet oxygen responsible for Sp formation. The increased yield of Sp in the buffered O-stabilizing solvent DO, formation of 2Ih in a short oligodeoxynucleotide, and O-isotope labeling provided evidence to support this mechanism. The elusiveness and challenges of working with 2Ih are described in a series of studies on the significant context effects on the half-life of the 2Ih glycosidic bond.

摘要

鸟苷的臭氧化作用形成了 5-羧酰胺基-5-甲酰胺基-2-亚氨基海因核苷(2Ih)核苷,同时还有痕量的螺环亚氨基二氢嘧啶(Sp)。根据文献先例,我们提出了一种非传统的臭氧机制,其中只涉及一个氧原子的掺入 O,形成 2Ih,同时释放出 singlet oxygen,后者负责 Sp 的形成。缓冲 O 稳定溶剂 DO 中 Sp 产量的增加、短寡脱氧核苷酸中 2Ih 的形成以及 O 同位素标记提供了证据支持该机制。在一系列关于 2Ih 糖苷键半衰期的显著上下文效应的研究中,描述了与 2Ih 相关的难以捉摸和挑战。

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