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DNA 损伤时 R 环复合物的邻近连接检测。

Proximity Ligation Assay for Detection of R-Loop Complexes upon DNA Damage.

机构信息

Sir William Dunn School of Pathology, University of Oxford, Oxford, UK.

出版信息

Methods Mol Biol. 2022;2528:289-303. doi: 10.1007/978-1-0716-2477-7_19.

Abstract

In situ Proximity Ligation Assay (PLA ) can be used to detect the close proximity (less than ~40 nm) of two biological molecules of interest in cells. Here we report the application of this method for the specific detection of R-loop interacting proteins and RNA modifications in close proximity to R-loops in non-damage and ionizing radiation (IR) induced DNA damage conditions.

摘要

原位邻近连接分析(PLA)可用于检测细胞中两个感兴趣的生物分子的近距离(小于~40nm)。本文报告了该方法在非损伤和电离辐射(IR)诱导的 DNA 损伤条件下,特异性检测 R 环相互作用蛋白和 RNA 修饰在 R 环附近的应用。

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