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美国俄勒冈州临床与污水 SARS-CoV-2 基因组监测的相关性

Correlation between Clinical and Wastewater SARS-CoV-2 Genomic Surveillance, Oregon, USA.

出版信息

Emerg Infect Dis. 2022 Sep;28(9):1906-1908. doi: 10.3201/eid2809.220938. Epub 2022 Jul 15.

DOI:10.3201/eid2809.220938
PMID:35840124
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9423899/
Abstract

SARS-CoV-2 variant proportions in a population can be estimated through genomic sequencing of clinical specimens or wastewater samples. We demonstrate strong pairwise correlation between statewide variant estimates in Oregon, USA, derived from both methods (correlation coefficient 0.97). Our results provide crucial evidence of the effectiveness of community-level genomic surveillance.

摘要

通过对临床标本或废水样本进行基因组测序，可以估计人群中 SARS-CoV-2 变异株的比例。我们在美国俄勒冈州展示了两种方法（相关系数为 0.97）得出的全州变异株估计值之间的强相关性。我们的研究结果提供了重要证据，证明了社区级基因组监测的有效性。

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