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巴西南部新冠病毒二次感染病例的基因组证据。

Genomic evidence of SARS-CoV-2 reinfection cases in southern Brazil.

机构信息

Hospital Moinhos de Vento, PROADI-SUS, Porto Alegre, Brazil.

Department of Microbiology and Ophthalmology, Harvard Medical School and Mass Eye and Ear Infirmary, Boston, USA.

出版信息

Arch Virol. 2023 Jan 3;168(1):19. doi: 10.1007/s00705-022-05648-8.

DOI:10.1007/s00705-022-05648-8
PMID:36593369
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC9807423/
Abstract

Cases of reinfection with severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) have been reported worldwide. We investigated reinfection cases in a set of more than 30,000 samples, and the SARS-CoV-2 genomes from selected samples from four patients with at least two positive diagnoses with an interval ≥ 45 days between tests were sequenced and analyzed. Comparative genomic and phylogenetic analysis confirmed three reinfection cases and suggested that the fourth one was caused by a virus of the same lineage. Viral sequencing is crucial for understanding the natural course of reinfections and for planning public health strategies for management of COVID-19.

摘要

已在全球范围内报告了严重急性呼吸综合征冠状病毒 2(SARS-CoV-2)的再感染病例。我们对超过 30000 个样本的一组再感染病例进行了调查,并对至少两次阳性诊断、两次检测间隔≥45 天的四个患者的 SARS-CoV-2 基因组进行了测序和分析。比较基因组和系统发育分析证实了三例再感染病例,并提示第四例可能是由同一谱系的病毒引起的。病毒测序对于了解再感染的自然病程以及制定 COVID-19 管理的公共卫生策略至关重要。

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