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广泛存在的 miRNA 种子 8-氧鸟嘌呤修饰物差异调控氧化还原依赖型癌症发生。

Widespread 8-oxoguanine modifications of miRNA seeds differentially regulate redox-dependent cancer development.

机构信息

Department of Life Sciences, Korea University, Seoul, Korea.

KU-KIST Graduate School of Converging Science and Technology, Korea University, Seoul, Korea.

出版信息

Nat Cell Biol. 2023 Sep;25(9):1369-1383. doi: 10.1038/s41556-023-01209-6. Epub 2023 Sep 7.

DOI:10.1038/s41556-023-01209-6
PMID:37696949
Abstract

Oxidative stress contributes to tumourigenesis by altering gene expression. One accompanying modification, 8-oxoguanine (oG) can change RNA-RNA interactions via oG•A base pairing, but its regulatory roles remain elusive. Here, on the basis of oG-induced guanine-to-thymine (oG > T) variations featured in sequencing, we discovered widespread position-specific oGs in tumour microRNAs, preferentially oxidized towards 5' end seed regions (positions 2-8) with clustered sequence patterns and clinically associated with patients in lower-grade gliomas and liver hepatocellular carcinoma. We validated that oG at position 4 of miR-124 (4oG-miR-124) and 4oG-let-7 suppress lower-grade gliomas, whereas 3oG-miR-122 and 4oG-let-7 promote malignancy of liver hepatocellular carcinoma by redirecting the target transcriptome to oncogenic regulatory pathways. Stepwise oxidation from tumour-promoting 3oG-miR-122 to tumour-suppressing 2,3oG-miR-122 occurs and its specific modulation in mouse liver effectively attenuates diethylnitrosamine-induced hepatocarcinogenesis. These findings provide resources and insights into epitranscriptional oG regulation of microRNA functions, reprogrammed by redox changes, implicating its control for cancer treatment.

摘要

氧化应激通过改变基因表达促进肿瘤发生。一种伴随的修饰物 8-氧鸟嘌呤(oG)可以通过 oG•A 碱基配对改变 RNA-RNA 相互作用,但它的调节作用仍然难以捉摸。在这里,基于测序中 oG 诱导的鸟嘌呤到胸腺嘧啶(oG>T)变化,我们在肿瘤 microRNA 中发现了广泛的位置特异性 oG,优先氧化到 5'端种子区域(位置 2-8),具有聚类序列模式,并与低级别神经胶质瘤和肝癌患者临床相关。我们验证了 miR-124 位置 4 的 oG(4oG-miR-124)和 4oG-let-7 抑制低级别神经胶质瘤,而 3oG-miR-122 和 4oG-let-7 通过将靶转录组重定向到致癌调节途径来促进肝癌的恶性程度。从促进肿瘤的 3oG-miR-122 到抑制肿瘤的 2,3oG-miR-122 的逐步氧化发生,并且其在小鼠肝脏中的特异性调节有效减弱了二乙基亚硝胺诱导的肝癌发生。这些发现为氧化应激调节 microRNA 功能的表观转录 oG 提供了资源和见解,重新编程了氧化还原变化,暗示其控制癌症治疗的潜力。

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