• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

邓氏小蛾(林奈,1758年)的基因组序列。

The genome sequence of the dun-bar pinion, (Linnaeus, 1758).

作者信息

Boyes Douglas, Godfray Charles, Holland Peter W H

机构信息

UK Centre for Ecology and Hydrology, Wallingford, Oxfordshire, UK.

Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, Oxfordshire, OX1 3SZ, UK.

出版信息

Wellcome Open Res. 2022 Jul 13;7:189. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17925.1. eCollection 2022.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.17925.1
PMID:37745777
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10517310/
Abstract

We present a genome assembly from an individual male (dun-bar pinion; Arthropoda; Insecta; Lepidoptera; Noctuidae). The genome sequence is 825 megabases in span. The majority of the assembly (99.87%) is scaffolded into 32 chromosomal pseudomolecules with the Z chromosome assembled. The complete mitochondrial genome was also assembled and is 15.4 kilobases in length.

摘要

我们展示了一个来自雄性个体(暗褐小翅蛾;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;夜蛾科)的基因组组装。基因组序列跨度为825兆碱基。大部分组装序列(99.87%)被构建成32条染色体假分子,其中Z染色体已组装完成。完整的线粒体基因组也已组装完成,长度为15.4千碱基。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/8cecee454b25/wellcomeopenres-7-19863-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/2903f2020c1b/wellcomeopenres-7-19863-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/d8aa1e672c32/wellcomeopenres-7-19863-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/2e1a16abcd8d/wellcomeopenres-7-19863-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/cffd1ecc62a5/wellcomeopenres-7-19863-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/8cecee454b25/wellcomeopenres-7-19863-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/2903f2020c1b/wellcomeopenres-7-19863-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/d8aa1e672c32/wellcomeopenres-7-19863-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/2e1a16abcd8d/wellcomeopenres-7-19863-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/cffd1ecc62a5/wellcomeopenres-7-19863-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/6b3b/10517310/8cecee454b25/wellcomeopenres-7-19863-g0004.jpg

相似文献

1
The genome sequence of the dun-bar pinion, (Linnaeus, 1758).邓氏小蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2022 Jul 13;7:189. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17925.1. eCollection 2022.
2
The genome sequence of the Lunar-spotted Pinion, (Denis & Schiffermüller, 1775).月斑小蠹(Denis & Schiffermüller,1775)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Nov 23;8:545. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20148.1. eCollection 2023.
3
The genome sequence of the Brown-spot Pinion, (Linnaeus, 1761).褐斑小蠹(林奈,1761年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Nov 10;8:512. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20347.1. eCollection 2023.
4
The genome sequence of the Pinion-streaked Snout, (Stephens, 1834).
Wellcome Open Res. 2023 May 10;8:203. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19402.1. eCollection 2023.
5
The genome sequence of the White-pinion Spotted, (Fabricius, 1775).白翅斑蛾(法布里丘斯,1775年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Feb 29;9:96. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20841.1. eCollection 2024.
6
The genome sequence of the Grey Chi, (Linnaeus, 1761).灰鹡鸰(林奈,1761年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Apr 6;8:157. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19288.1. eCollection 2023.
7
The genome sequence of the large yellow underwing, (Linnaeus, 1758).大黄翅夜蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2022 Apr 1;7:119. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17747.1. eCollection 2022.
8
The genome sequence of the angle shades moth, (Linnaeus, 1758).榆绿天蛾的基因组序列,(林奈,1758年) 。
Wellcome Open Res. 2022 Mar 14;7:89. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17757.1. eCollection 2022.
9
The genome sequence of the Burnished Brass, (Linnaeus, 1758).铜色凤蝶(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Feb 15;8:82. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18990.1. eCollection 2023.
10
The genome sequence of the Figure of Eight, (Linnaeus, 1758).数字8图形(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Dec 5;8:554. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20497.1. eCollection 2023.

引用本文的文献

1
The genome sequence of the Lunar-spotted Pinion, (Denis & Schiffermüller, 1775).月斑小蠹(Denis & Schiffermüller,1775)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Nov 23;8:545. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20148.1. eCollection 2023.
2
The genome sequence of the Heart Moth, (Linnaeus 1758).心蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jul 21;8:318. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19535.1. eCollection 2023.

本文引用的文献

1
BUSCO Update: Novel and Streamlined Workflows along with Broader and Deeper Phylogenetic Coverage for Scoring of Eukaryotic, Prokaryotic, and Viral Genomes.BUSCO 更新:用于真核生物、原核生物和病毒基因组评分的新颖且简化的工作流程以及更广泛和更深的系统发育覆盖范围。
Mol Biol Evol. 2021 Sep 27;38(10):4647-4654. doi: 10.1093/molbev/msab199.
2
Significantly improving the quality of genome assemblies through curation.通过编辑显著提高基因组组装的质量。
Gigascience. 2021 Jan 9;10(1). doi: 10.1093/gigascience/giaa153.
3
HiCanu: accurate assembly of segmental duplications, satellites, and allelic variants from high-fidelity long reads.
HiCanu:从高保真长读段中精确组装片段重复、卫星和等位基因变体。
Genome Res. 2020 Sep;30(9):1291-1305. doi: 10.1101/gr.263566.120. Epub 2020 Aug 14.
4
MitoFinder: Efficient automated large-scale extraction of mitogenomic data in target enrichment phylogenomics.MitoFinder:目标富集系统发育基因组学中高效自动化的大规模线粒体基因组数据提取。
Mol Ecol Resour. 2020 Jul;20(4):892-905. doi: 10.1111/1755-0998.13160. Epub 2020 Apr 25.
5
BlobToolKit - Interactive Quality Assessment of Genome Assemblies.BlobToolKit - 基因组组装的交互式质量评估。
G3 (Bethesda). 2020 Apr 9;10(4):1361-1374. doi: 10.1534/g3.119.400908.
6
Identifying and removing haplotypic duplication in primary genome assemblies.鉴定和去除初级基因组组装中的单倍型重复。
Bioinformatics. 2020 May 1;36(9):2896-2898. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa025.
7
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly.将 Hi-C 链接与组装图整合用于染色体尺度的组装。
PLoS Comput Biol. 2019 Aug 21;15(8):e1007273. doi: 10.1371/journal.pcbi.1007273. eCollection 2019 Aug.
8
HiGlass: web-based visual exploration and analysis of genome interaction maps.HiGlass:基于网络的基因组互作图谱可视化探索和分析工具
Genome Biol. 2018 Aug 24;19(1):125. doi: 10.1186/s13059-018-1486-1.
9
gEVAL - a web-based browser for evaluating genome assemblies.gEVAL——一个用于评估基因组组装的基于网络的浏览器。
Bioinformatics. 2016 Aug 15;32(16):2508-10. doi: 10.1093/bioinformatics/btw159. Epub 2016 Apr 7.
10
A 3D map of the human genome at kilobase resolution reveals principles of chromatin looping.一份碱基对分辨率的人类基因组三维图谱揭示了染色质环化的原理。
Cell. 2014 Dec 18;159(7):1665-80. doi: 10.1016/j.cell.2014.11.021. Epub 2014 Dec 11.