• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

孔雀蛾的基因组序列,(林奈,1758年)。

The genome sequence of the peacock moth, (Linnaeus, 1758).

作者信息

Boyes Douglas, Couch Christian, Plotkin David, Kawahara Akito Y

机构信息

UK Centre for Ecology and Hydrology, Wallingford, Oxfordshire, UK.

McGuire Center for Lepidoptera and Biodiversity, Florida Museum of Natural History, Gainesville, Florida, USA.

出版信息

Wellcome Open Res. 2022 Sep 12;7:228. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18108.1. eCollection 2022.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.18108.1
PMID:37767015
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10521120/
Abstract

We present a genome assembly from an individual male (the peacock moth; Arthropoda; Insecta; Lepidoptera; Geometridae). The genome sequence is 394 megabases in span. The majority of the assembly (99.98%) is scaffolded into 29 chromosomal pseudomolecules with the Z sex chromosome assembled. The complete mitochondrial genome was also assembled and is 15.4 kilobases in length.

摘要

我们展示了一个来自雄性个体(孔雀蛾;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;尺蛾科)的基因组组装结果。基因组序列跨度为394兆碱基。大部分组装序列(99.98%)被构建成29条染色体假分子,其中Z性染色体也已组装完成。完整的线粒体基因组也已组装完成,长度为15.4千碱基。

相似文献

1
The genome sequence of the peacock moth, (Linnaeus, 1758).孔雀蛾的基因组序列,(林奈,1758年)。
Wellcome Open Res. 2022 Sep 12;7:228. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18108.1. eCollection 2022.
2
The genome sequence of the brimstone moth, (Linnaeus, 1758).黄粉蝶(粉蝶科)的基因组序列,(林奈,1758年)。 (注:这里“brimstone moth”可能有误,结合后面分类信息推测应该是“brimstone butterfly”即“黄粉蝶”,因为林奈主要对昆虫等进行分类,且括号内是粉蝶科相关分类信息,按照粉蝶科来翻译更符合逻辑。)
Wellcome Open Res. 2022 Sep 12;7:227. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18101.1. eCollection 2022.
3
The genome sequence of the peppered moth, Linnaeus, 1758.桦尺蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2022 Mar 17;7:97. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17578.1. eCollection 2022.
4
The genome sequence of the Rivulet moth, (Stephens, 1831).小沟蛾(斯蒂芬斯,1831年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Mar 4;9:127. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21016.1. eCollection 2024.
5
The genome sequence of the Leopard Moth, (Linnaeus, 1761).豹蠹蛾(豹蛾)的基因组序列,(林奈,1761年) 。
Wellcome Open Res. 2023 Feb 22;8:94. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19064.1. eCollection 2023.
6
The genome sequence of the Spruce Carpet Moth, (Turner, 1925).云杉地毯蛾的基因组序列,(特纳,1925年)。
Wellcome Open Res. 2023 Mar 10;8:114. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19107.1. eCollection 2023.
7
The genome sequence of the peach blossom moth, (Linnaeus, 1758).桃蛀螟(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2021 Oct 13;6:267. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17268.1. eCollection 2021.
8
The genome sequence of the Emperor moth, (Linnaeus, 1758).皇蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Feb 19;9:48. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20652.1. eCollection 2024.
9
The genome sequence of the Diamondback Moth, (Linnaeus, 1758).小菜蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Sep 18;8:404. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20006.1. eCollection 2023.
10
The genome sequence of the Muslin Footman moth, (Linnaeus, 1761).锦葵尺蛾(林奈,1761年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 May 21;9:283. doi: 10.12688/wellcomeopenres.22252.1. eCollection 2024.

本文引用的文献

1
YaHS: yet another Hi-C scaffolding tool.YaHS:另一个 Hi-C 支架工具。
Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1). doi: 10.1093/bioinformatics/btac808.
2
BUSCO Update: Novel and Streamlined Workflows along with Broader and Deeper Phylogenetic Coverage for Scoring of Eukaryotic, Prokaryotic, and Viral Genomes.BUSCO 更新:用于真核生物、原核生物和病毒基因组评分的新颖且简化的工作流程以及更广泛和更深的系统发育覆盖范围。
Mol Biol Evol. 2021 Sep 27;38(10):4647-4654. doi: 10.1093/molbev/msab199.
3
Haplotype-resolved de novo assembly using phased assembly graphs with hifiasm.
使用带有 hifiasm 的相定装配图进行单体型解析从头组装。
Nat Methods. 2021 Feb;18(2):170-175. doi: 10.1038/s41592-020-01056-5. Epub 2021 Feb 1.
4
Significantly improving the quality of genome assemblies through curation.通过编辑显著提高基因组组装的质量。
Gigascience. 2021 Jan 9;10(1). doi: 10.1093/gigascience/giaa153.
5
MitoFinder: Efficient automated large-scale extraction of mitogenomic data in target enrichment phylogenomics.MitoFinder:目标富集系统发育基因组学中高效自动化的大规模线粒体基因组数据提取。
Mol Ecol Resour. 2020 Jul;20(4):892-905. doi: 10.1111/1755-0998.13160. Epub 2020 Apr 25.
6
BlobToolKit - Interactive Quality Assessment of Genome Assemblies.BlobToolKit - 基因组组装的交互式质量评估。
G3 (Bethesda). 2020 Apr 9;10(4):1361-1374. doi: 10.1534/g3.119.400908.
7
Identifying and removing haplotypic duplication in primary genome assemblies.鉴定和去除初级基因组组装中的单倍型重复。
Bioinformatics. 2020 May 1;36(9):2896-2898. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa025.
8
HiGlass: web-based visual exploration and analysis of genome interaction maps.HiGlass:基于网络的基因组互作图谱可视化探索和分析工具
Genome Biol. 2018 Aug 24;19(1):125. doi: 10.1186/s13059-018-1486-1.
9
A 3D map of the human genome at kilobase resolution reveals principles of chromatin looping.一份碱基对分辨率的人类基因组三维图谱揭示了染色质环化的原理。
Cell. 2014 Dec 18;159(7):1665-80. doi: 10.1016/j.cell.2014.11.021. Epub 2014 Dec 11.