• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

桃蛀螟(林奈,1758年)的基因组序列。

The genome sequence of the peach blossom moth, (Linnaeus, 1758).

作者信息

Boyes Douglas, Holland Peter W H

机构信息

UK Centre for Ecology & Hydrology, Wallingford, OX10 8BB, UK.

Department of Zoology, University of Oxford, Oxford, OX1 3SZ, UK.

出版信息

Wellcome Open Res. 2021 Oct 13;6:267. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17268.1. eCollection 2021.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.17268.1
PMID:35252591
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC8874031/
Abstract

We present a genome assembly from an individual male (the peach-blossom moth; Arthropoda; Insecta; Lepidoptera; Drepanidae). The genome sequence is 315 megabases in span. The majority of the assembly (99.68%) is scaffolded into 31 chromosomal pseudomolecules, with the Z sex chromosome assembled. The mitochondrial genome was also assembled and is 15.4 kilobases in length. Gene annotation of this assembly on Ensembl has identified 12,238 protein coding genes.

摘要

我们展示了一个来自雄性个体(桃斑蛾;节肢动物门;昆虫纲;鳞翅目;钩蛾科)的基因组组装结果。基因组序列跨度为315兆碱基。大部分组装序列(99.68%)被构建成31条染色体假分子,其中Z性染色体也已组装完成。线粒体基因组也已组装完成,长度为15.4千碱基。在Ensembl上对该组装序列进行的基因注释已鉴定出12238个蛋白质编码基因。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/7f4b9a1be03b/wellcomeopenres-6-19086-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/b817e488f99a/wellcomeopenres-6-19086-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/7626b2ca9cbb/wellcomeopenres-6-19086-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/0852821684ff/wellcomeopenres-6-19086-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/3ef5dace365c/wellcomeopenres-6-19086-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/7f4b9a1be03b/wellcomeopenres-6-19086-g0004.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/b817e488f99a/wellcomeopenres-6-19086-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/7626b2ca9cbb/wellcomeopenres-6-19086-g0001.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/0852821684ff/wellcomeopenres-6-19086-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/3ef5dace365c/wellcomeopenres-6-19086-g0003.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/791a/8874031/7f4b9a1be03b/wellcomeopenres-6-19086-g0004.jpg

相似文献

1
The genome sequence of the peach blossom moth, (Linnaeus, 1758).桃蛀螟(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2021 Oct 13;6:267. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17268.1. eCollection 2021.
2
The genome sequence of the Leopard Moth, (Linnaeus, 1761).豹蠹蛾(豹蛾)的基因组序列,(林奈,1761年) 。
Wellcome Open Res. 2023 Feb 22;8:94. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19064.1. eCollection 2023.
3
The genome sequence of the Emperor moth, (Linnaeus, 1758).皇蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Feb 19;9:48. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20652.1. eCollection 2024.
4
The genome sequence of the Diamondback Moth, (Linnaeus, 1758).小菜蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Sep 18;8:404. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20006.1. eCollection 2023.
5
The genome sequence of the Heart Moth, (Linnaeus 1758).心蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jul 21;8:318. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19535.1. eCollection 2023.
6
The genome sequence of the Scarlet Tiger moth, (Linnaeus, 1758).猩红虎蛾(林奈,1758 年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Feb 12;9:31. doi: 10.12688/wellcomeopenres.20833.1. eCollection 2024.
7
The genome sequence of the Spruce-seed moth, (Linnaeus, 1758).云杉种子蛾的基因组序列,(林奈,1758年)。
Wellcome Open Res. 2024 Apr 2;9:177. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21214.1. eCollection 2024.
8
The genome sequence of the Elephant Hawk-moth, (Linnaeus, 1758).小豆长喙天蛾的基因组序列,(林奈,1758年)。
Wellcome Open Res. 2024 Mar 1;9:104. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21012.1. eCollection 2024.
9
The genome sequence of the Figure of Eighty moth Linnaeus, 1767.1767年林奈命名的数字8蛾的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 Jun 28;9:348. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21493.1. eCollection 2024.
10
The genome sequence of the peppered moth, Linnaeus, 1758.桦尺蛾(林奈,1758年)的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2022 Mar 17;7:97. doi: 10.12688/wellcomeopenres.17578.1. eCollection 2022.

本文引用的文献

1
RNAsamba: neural network-based assessment of the protein-coding potential of RNA sequences.RNAsamba:基于神经网络的RNA序列蛋白质编码潜力评估
NAR Genom Bioinform. 2020 Jan 13;2(1):lqz024. doi: 10.1093/nargab/lqz024. eCollection 2020 Mar.
2
Significantly improving the quality of genome assemblies through curation.通过编辑显著提高基因组组装的质量。
Gigascience. 2021 Jan 9;10(1). doi: 10.1093/gigascience/giaa153.
3
HiCanu: accurate assembly of segmental duplications, satellites, and allelic variants from high-fidelity long reads.
HiCanu:从高保真长读段中精确组装片段重复、卫星和等位基因变体。
Genome Res. 2020 Sep;30(9):1291-1305. doi: 10.1101/gr.263566.120. Epub 2020 Aug 14.
4
BlobToolKit - Interactive Quality Assessment of Genome Assemblies.BlobToolKit - 基因组组装的交互式质量评估。
G3 (Bethesda). 2020 Apr 9;10(4):1361-1374. doi: 10.1534/g3.119.400908.
5
Identifying and removing haplotypic duplication in primary genome assemblies.鉴定和去除初级基因组组装中的单倍型重复。
Bioinformatics. 2020 May 1;36(9):2896-2898. doi: 10.1093/bioinformatics/btaa025.
6
Integrating Hi-C links with assembly graphs for chromosome-scale assembly.将 Hi-C 链接与组装图整合用于染色体尺度的组装。
PLoS Comput Biol. 2019 Aug 21;15(8):e1007273. doi: 10.1371/journal.pcbi.1007273. eCollection 2019 Aug.
7
UniProt: a worldwide hub of protein knowledge.UniProt:蛋白质知识的全球枢纽。
Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D506-D515. doi: 10.1093/nar/gky1049.
8
HiGlass: web-based visual exploration and analysis of genome interaction maps.HiGlass:基于网络的基因组互作图谱可视化探索和分析工具
Genome Biol. 2018 Aug 24;19(1):125. doi: 10.1186/s13059-018-1486-1.
9
CPC2: a fast and accurate coding potential calculator based on sequence intrinsic features.CPC2:一种基于序列固有特征的快速准确编码潜能计算器。
Nucleic Acids Res. 2017 Jul 3;45(W1):W12-W16. doi: 10.1093/nar/gkx428.
10
The Ensembl gene annotation system.Ensembl基因注释系统。
Database (Oxford). 2016 Jun 23;2016. doi: 10.1093/database/baw093. Print 2016.