• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利:CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法,用中文像聊天一样搜索,搜遍4000万医学文献。AI智能推荐,让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版,准确专业,支持PDF/Word/PPT等文件格式,支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述,25分钟生成高质量综述,智能提取关键信息,辅助科研写作。

立即免费体验

Genetic differentiation at probe SNPs leads to spurious results in meQTL discovery.

作者信息

Meeks Gillian L, Henn Brenna M, Gopalan Shyamalika

机构信息

Graduate Program in Integrative Genetics and Genomics, University of California Davis, Davis, CA, 95616, USA.

Department of Anthropology, University of California Davis, Davis, CA, 95616, USA.

出版信息

Commun Biol. 2023 Dec 21;6(1):1295. doi: 10.1038/s42003-023-05658-5.

DOI:10.1038/s42003-023-05658-5
PMID:38129663
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC10739831/
Abstract
摘要
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/069d/10739831/c23ae4eb6639/42003_2023_5658_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/069d/10739831/19d73667da5d/42003_2023_5658_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/069d/10739831/c23ae4eb6639/42003_2023_5658_Fig2_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/069d/10739831/19d73667da5d/42003_2023_5658_Fig1_HTML.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/069d/10739831/c23ae4eb6639/42003_2023_5658_Fig2_HTML.jpg

相似文献

1
Genetic differentiation at probe SNPs leads to spurious results in meQTL discovery.探针单核苷酸多态性(SNP)处的遗传分化会导致甲基化定量性状位点(meQTL)发现中出现虚假结果。
Commun Biol. 2023 Dec 21;6(1):1295. doi: 10.1038/s42003-023-05658-5.
2
Reply to: Genetic differentiation at probe SNPs leads to spurious results in meQTL discovery.回复:探针单核苷酸多态性处的基因分化会导致甲基化定量性状位点发现中的虚假结果。
Commun Biol. 2023 Dec 21;6(1):1296. doi: 10.1038/s42003-023-05646-9.
3
SNPs located at CpG sites modulate genome-epigenome interaction.位于 CpG 位点的单核苷酸多态性调节基因组-表观基因组相互作用。
Epigenetics. 2013 Aug;8(8):802-6. doi: 10.4161/epi.25501. Epub 2013 Jun 28.
4
High density methylation QTL analysis in human blood via next-generation sequencing of the methylated genomic DNA fraction.通过甲基化基因组DNA片段的下一代测序对人类血液进行高密度甲基化QTL分析。
Genome Biol. 2015 Dec 23;16:291. doi: 10.1186/s13059-015-0842-7.
5
Genetic regulation of differentially methylated genes in visceral adipose tissue of severely obese men discordant for the metabolic syndrome.重度肥胖男性内脏脂肪组织中代谢综合征不一致的差异甲基化基因的遗传调控。
Transl Res. 2017 Jun;184:1-11.e2. doi: 10.1016/j.trsl.2017.01.002. Epub 2017 Feb 2.
6
An alternative approach to multiple testing for methylation QTL mapping reduces the proportion of falsely identified CpGs.一种用于甲基化 QTL 作图的多重检验替代方法可减少假阳性 CpG 的比例。
Bioinformatics. 2015 Feb 1;31(3):340-5. doi: 10.1093/bioinformatics/btu654. Epub 2014 Oct 4.
7
The presence of methylation quantitative trait loci indicates a direct genetic influence on the level of DNA methylation in adipose tissue.甲基化数量性状位点的存在表明对脂肪组织中 DNA 甲基化水平有直接的遗传影响。
PLoS One. 2013;8(2):e55923. doi: 10.1371/journal.pone.0055923. Epub 2013 Feb 19.
8
Pancan-meQTL: a database to systematically evaluate the effects of genetic variants on methylation in human cancer.泛癌甲基化 QTL(pan-cancer methylation quantitative trait loci,panCan-meQTL)数据库:用于系统评估遗传变异对人类癌症中甲基化影响的数据库。
Nucleic Acids Res. 2019 Jan 8;47(D1):D1066-D1072. doi: 10.1093/nar/gky814.
9
meQTL mapping in the GENOA study reveals genetic determinants of DNA methylation in African Americans.在 GENOA 研究中进行的 meQTL 图谱分析揭示了非裔美国人 DNA 甲基化的遗传决定因素。
Nat Commun. 2023 May 11;14(1):2711. doi: 10.1038/s41467-023-37961-4.
10
Linking genetic variation with epigenetic profiles in Sjögren's syndrome.将遗传变异与干燥综合征的表观遗传谱联系起来。
Clin Immunol. 2020 Jan;210:108314. doi: 10.1016/j.clim.2019.108314. Epub 2019 Nov 22.

引用本文的文献

1
CanASM: a comprehensive database for genome-wide allele-specific DNA methylation identification and annotation in cancer.CanASM:一个用于癌症全基因组等位基因特异性DNA甲基化鉴定和注释的综合数据库。
BMC Genomics. 2025 Jul 9;26(1):648. doi: 10.1186/s12864-025-11849-7.
2
Common DNA sequence variation influences epigenetic aging in African populations.常见的DNA序列变异影响非洲人群的表观遗传衰老。
bioRxiv. 2024 Aug 26:2024.08.26.608843. doi: 10.1101/2024.08.26.608843.

本文引用的文献

1
Revisiting genetic artifacts on DNA methylation microarrays exposes novel biological implications.重新审视 DNA 甲基化微阵列上的遗传伪影揭示了新的生物学意义。
Genome Biol. 2021 Sep 21;22(1):274. doi: 10.1186/s13059-021-02484-y.
2
Genome-wide identification of DNA methylation QTLs in whole blood highlights pathways for cardiovascular disease.全血细胞中 DNA 甲基化 QTL 的全基因组鉴定突出了心血管疾病的相关途径。
Nat Commun. 2019 Sep 19;10(1):4267. doi: 10.1038/s41467-019-12228-z.
3
Worldwide patterns of human epigenetic variation.人类表观遗传变异的全球模式。
Nat Ecol Evol. 2017 Oct;1(10):1577-1583. doi: 10.1038/s41559-017-0299-z. Epub 2017 Aug 28.
4
Genome-wide methylation data mirror ancestry information.全基因组甲基化数据反映祖先信息。
Epigenetics Chromatin. 2017 Jan 3;10:1. doi: 10.1186/s13072-016-0108-y. eCollection 2017.
5
Evidence of epigenetic admixture in the Colombian population.哥伦比亚人群中表观遗传混合的证据。
Hum Mol Genet. 2017 Feb 1;26(3):501-508. doi: 10.1093/hmg/ddw407.
6
Differential methylation between ethnic sub-groups reflects the effect of genetic ancestry and environmental exposures.不同种族亚组之间的差异甲基化反映了遗传血统和环境暴露的影响。
Elife. 2017 Jan 3;6:e20532. doi: 10.7554/eLife.20532.
7
A global reference for human genetic variation.人类遗传变异的全球参考。
Nature. 2015 Oct 1;526(7571):68-74. doi: 10.1038/nature15393.
8
DNA methylation contributes to natural human variation.DNA 甲基化有助于自然的人类变异。
Genome Res. 2013 Sep;23(9):1363-72. doi: 10.1101/gr.154187.112. Epub 2013 Aug 1.
9
SNPs located at CpG sites modulate genome-epigenome interaction.位于 CpG 位点的单核苷酸多态性调节基因组-表观基因组相互作用。
Epigenetics. 2013 Aug;8(8):802-6. doi: 10.4161/epi.25501. Epub 2013 Jun 28.
10
Additional annotation enhances potential for biologically-relevant analysis of the Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip array.额外的注释增强了 Illumina Infinium HumanMethylation450 BeadChip 阵列进行生物相关分析的潜力。
Epigenetics Chromatin. 2013 Mar 3;6(1):4. doi: 10.1186/1756-8935-6-4.