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林克茵:路线算法─数字综合路线的运算。

LinChemIn: Route Arithmetic─Operations on Digital Synthetic Routes.

机构信息

Syngenta Crop Protection AG, Schaffhauserstrasse, 4332 Stein, AG, Switzerland.

出版信息

J Chem Inf Model. 2024 Mar 25;64(6):1765-1771. doi: 10.1021/acs.jcim.3c01819. Epub 2024 Mar 13.

DOI:10.1021/acs.jcim.3c01819
PMID:38480486
Abstract

Computational tools are revolutionizing our understanding and prediction of chemical reactivity by combining traditional data analysis techniques with new predictive models. These tools extract additional value from the reaction data , but to effectively convert this value into actionable knowledge, domain specialists need to interact easily with the computer-generated output. In this application note, we demonstrate the capabilities of the open-source Python toolkit LinChemIn, which simplifies the manipulation of reaction networks and provides advanced functionality for working with synthetic routes. LinChemIn ensures chemical consistency when merging, editing, mining, and analyzing reaction networks. Its flexible input interface can process routes from various sources, including predictive models and expert input. The toolkit also efficiently extracts individual routes from the combined synthetic tree, identifying alternative paths and reaction combinations. By reducing the operational barrier to accessing and analyzing synthetic routes from multiple sources, LinChemIn facilitates a constructive interplay between artificial intelligence and human expertise.

摘要

计算工具通过将传统数据分析技术与新的预测模型相结合,正在彻底改变我们对化学反应性的理解和预测。这些工具从反应数据中提取额外的价值,但为了有效地将这些价值转化为可操作的知识,领域专家需要能够轻松地与计算机生成的输出进行交互。在本应用说明中,我们展示了开源 Python 工具包 LinChemIn 的功能,该工具包简化了反应网络的操作,并为处理合成路线提供了高级功能。LinChemIn 在合并、编辑、挖掘和分析反应网络时确保了化学一致性。其灵活的输入接口可以处理来自各种来源的路线,包括预测模型和专家输入。该工具包还可以从组合的合成树中高效地提取单个路线,识别替代路径和反应组合。通过降低从多个来源访问和分析合成路线的操作障碍,LinChemIn 促进了人工智能和人类专业知识之间的建设性相互作用。

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引用本文的文献

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