• 文献检索
  • 文档翻译
  • 深度研究
  • 学术资讯
  • Suppr Zotero 插件Zotero 插件
  • 邀请有礼
  • 套餐&价格
  • 历史记录
应用&插件
Suppr Zotero 插件Zotero 插件浏览器插件Mac 客户端Windows 客户端微信小程序
定价
高级版会员购买积分包购买API积分包
服务
文献检索文档翻译深度研究API 文档MCP 服务
关于我们
关于 Suppr公司介绍联系我们用户协议隐私条款
关注我们

Suppr 超能文献

核心技术专利：CN118964589B侵权必究
粤ICP备2023148730 号-1Suppr @ 2026

文献检索

告别复杂PubMed语法，用中文像聊天一样搜索，搜遍4000万医学文献。AI智能推荐，让科研检索更轻松。

立即免费搜索

文件翻译

保留排版，准确专业，支持PDF/Word/PPT等文件格式，支持 12+语言互译。

免费翻译文档

深度研究

AI帮你快速写综述，25分钟生成高质量综述，智能提取关键信息，辅助科研写作。

立即免费体验

一种寄蝇（潘泽，1809年）的基因组序列。

The genome sequence of a tachinid fly, (Panzer, 1809).

作者信息

Falk Steven, Raper Chris

机构信息

Independent researcher, Kenilworth, England, UK.

Natural History Museum, London, England, UK.

出版信息

Wellcome Open Res. 2023 Jun 23;8:275. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19575.1. eCollection 2023.

DOI:10.12688/wellcomeopenres.19575.1
PMID:38919871
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11196934/
Abstract

We present a genome assembly from an individual female (a tachinid fly; Arthropoda; Insecta; Diptera; Tachinidae). The genome sequence is 670.7 megabases in span. Most of the assembly is scaffolded into 6 chromosomal pseudomolecules, including the X sex chromosome. The mitochondrial genome has also been assembled and is 17.19 kilobases in length. Gene annotation of this assembly on Ensembl identified 27,893 protein coding genes.

摘要

我们展示了来自一只雌性个体（一种寄蝇；节肢动物门；昆虫纲；双翅目；寄蝇科）的基因组组装结果。基因组序列跨度为670.7兆碱基。大部分组装序列被构建成6条染色体假分子，包括X性染色体。线粒体基因组也已组装完成，长度为17.19千碱基。在Ensembl上对该组装序列进行的基因注释识别出27,893个蛋白质编码基因。

https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8950/11196934/996abf1d9f0c/wellcomeopenres-8-21685-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8950/11196934/26aea0dbc77d/wellcomeopenres-8-21685-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8950/11196934/996abf1d9f0c/wellcomeopenres-8-21685-g0002.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8950/11196934/26aea0dbc77d/wellcomeopenres-8-21685-g0000.jpg
https://cdn.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/blobs/8950/11196934/996abf1d9f0c/wellcomeopenres-8-21685-g0002.jpg

相似文献

1
The genome sequence of a tachinid fly, (Panzer, 1809).一种寄蝇（潘泽，1809年）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jun 23;8:275. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19575.1. eCollection 2023.
2
The genome sequence of a tachinid fly, (Fabricius, 1781).一种寄蝇（法布里丘斯，1781年）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jul 7;8:288. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19635.1. eCollection 2023.
3
The genome sequence of a tachinid fly, (Fabricius, 1775).一种寄蝇（法布里丘斯，1775年）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Oct 13;8:462. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19924.1. eCollection 2023.
4
The genome sequence of the tachinid fly, (Meigen, 1824).寄蝇（Meigen，1824年）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jun 23;8:276. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19586.1. eCollection 2023.
5
The genome sequence of a tachinid fly, (Harris, 1780).一只寄蝇（哈里斯，1780年）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Dec 5;8:564. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19639.1. eCollection 2023.
6
The genome sequence of a tachinid fly, (Robineau-Desvoidy, 1830).一种寄蝇（Robineau-Desvoidy，1830年）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2024 May 9;9:243. doi: 10.12688/wellcomeopenres.21499.1. eCollection 2024.
7
The genome sequence of the Locust Fly, (Fabricius, 1805).褐足飞蝗（法布里丘斯，1805年）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Aug 2;8:330. doi: 10.12688/wellcomeopenres.19532.1. eCollection 2023.
8
The genome sequence of a snail-killing fly, (Scopoli, 1763).一种杀蜗牛蝇（斯氏嗜蜗牛蝇，1763年，斯科波利）的基因组序列。
Wellcome Open Res. 2023 Jan 19;8:30. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18790.1. eCollection 2023.
9
The genome sequence of the lesser worm flesh fly, ( )  Rohdendorf, 1937.小家蝇的基因组序列，（ ）罗德endorf，1937年。 （注：此处括号内容原文缺失，翻译只能照原样呈现）
Wellcome Open Res. 2024 Sep 4;8:65. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18717.2. eCollection 2023.
10
The genome of Roselle's flesh fly ( ) Böttcher, 1912).玫瑰实蝇的基因组（博特彻，1912年）
Wellcome Open Res. 2023 Jan 31;8:43. doi: 10.12688/wellcomeopenres.18874.1. eCollection 2023.

本文引用的文献

1
MitoHiFi: a python pipeline for mitochondrial genome assembly from PacBio high fidelity reads.MitoHiFi：一个从 PacBio 高保真reads 组装线粒体基因组的 Python 分析流程
BMC Bioinformatics. 2023 Jul 18;24(1):288. doi: 10.1186/s12859-023-05385-y.
2
YaHS: yet another Hi-C scaffolding tool.YaHS：另一个 Hi-C 支架工具。
Bioinformatics. 2023 Jan 1;39(1). doi: 10.1093/bioinformatics/btac808.
3
BUSCO Update: Novel and Streamlined Workflows along with Broader and Deeper Phylogenetic Coverage for Scoring of Eukaryotic, Prokaryotic, and Viral Genomes.
BUSCO 更新：用于真核生物、原核生物和病毒基因组评分的新颖且简化的工作流程以及更广泛和更深的系统发育覆盖范围。
Mol Biol Evol. 2021 Sep 27;38(10):4647-4654. doi: 10.1093/molbev/msab199.
4
Towards complete and error-free genome assemblies of all vertebrate species.致力于完成所有脊椎动物物种的完整且无错误的基因组组装。
Nature. 2021 Apr;592(7856):737-746. doi: 10.1038/s41586-021-03451-0. Epub 2021 Apr 28.
5
BRAKER2: automatic eukaryotic genome annotation with GeneMark-EP+ and AUGUSTUS supported by a protein database.BRAKER2：借助蛋白质数据库，由GeneMark-EP+和AUGUSTUS支持的真核生物基因组自动注释工具。
NAR Genom Bioinform. 2021 Jan 6;3(1):lqaa108. doi: 10.1093/nargab/lqaa108. eCollection 2021 Mar.
6
Haplotype-resolved de novo assembly using phased assembly graphs with hifiasm.使用带有 hifiasm 的相定装配图进行单体型解析从头组装。
Nat Methods. 2021 Feb;18(2):170-175. doi: 10.1038/s41592-020-01056-5. Epub 2021 Feb 1.
7
Significantly improving the quality of genome assemblies through curation.通过编辑显著提高基因组组装的质量。
Gigascience. 2021 Jan 9;10(1). doi: 10.1093/gigascience/giaa153.
8
Merqury: reference-free quality, completeness, and phasing assessment for genome assemblies.Merqury：基因组组装的无参考质量、完整性和相位评估。
Genome Biol. 2020 Sep 14;21(1):245. doi: 10.1186/s13059-020-02134-9.
9
MitoFinder: Efficient automated large-scale extraction of mitogenomic data in target enrichment phylogenomics.MitoFinder：目标富集系统发育基因组学中高效自动化的大规模线粒体基因组数据提取。
Mol Ecol Resour. 2020 Jul;20(4):892-905. doi: 10.1111/1755-0998.13160. Epub 2020 Apr 25.
10
BlobToolKit - Interactive Quality Assessment of Genome Assemblies.BlobToolKit - 基因组组装的交互式质量评估。
G3 (Bethesda). 2020 Apr 9;10(4):1361-1374. doi: 10.1534/g3.119.400908.