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单细胞 RNA 测序数据质量控制和下游分析实用手册。

A practical handbook on single-cell RNA sequencing data quality control and downstream analysis.

机构信息

School of Life Sciences, Gwangju Institute of Science and Technology (GIST), Gwangju 61005, Republic of Korea.

School of Life Sciences, Gwangju Institute of Science and Technology (GIST), Gwangju 61005, Republic of Korea.

出版信息

Mol Cells. 2024 Sep;47(9):100103. doi: 10.1016/j.mocell.2024.100103. Epub 2024 Jul 31.

DOI:10.1016/j.mocell.2024.100103
PMID:39094968
原文链接:https://pmc.ncbi.nlm.nih.gov/articles/PMC11374959/
Abstract

Advancements in single-cell analysis have facilitated high-resolution observation of the transcriptome in individual cells. However, standards for obtaining high-quality cells and data analysis pipelines remain variable. Here, we provide the groundwork for improving the quality of single-cell analysis by delineating guidelines for selecting high-quality cells and considerations throughout the analysis. This review will streamline researchers' access to single-cell analysis and serve as a valuable guide for analysis.

摘要

单细胞分析的进展促进了单个细胞中转录组的高分辨率观察。然而，获得高质量细胞和数据分析管道的标准仍然存在差异。在这里，我们通过描绘选择高质量细胞的指南和整个分析过程中的注意事项，为提高单细胞分析的质量奠定了基础。这篇综述将简化研究人员对单细胞分析的访问，并为分析提供有价值的指导。

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